Ziel
To isolate and identify new genes from Atlantic salmon using a strategy based on cloning expressed sequence tags (ESTs).
Messenger RNA (mRNA) will be prepared from nine adult salmon tissues (i.e. male and female gonad, liver, spleen, kidney, intestine, gill, brain, muscle) and used to generate cDNA libraries. Other tissues from salmon challenged with pathogens and salmon that are immuno-stimulated will also be included. Clones will be selected representing the abundant and rare mRNA transcripts in each library and 400-600 bp of their DNA sequence will be elucidated. Between 500 and 1000 ESTs will be determined from each tissue, resulting in a detailed identification of the genes that are transcriptionally active in each chosen tissue. Selected ESTs (a minimum of 50 per partner), representing the most abundant mRNAs in each respective tissue and mRNAs of particular interest based on homology searches in the international databases, will be tested for their tissue specific expression patterns among other salmon tissues.
RESEARCH TASKS
The SALGENE partners will prepare poly(A) messenger RNA (mRNA) from the chosen salmon tissues and construct complementary DNA (cDNA) libraries using molecular genetic methods. Following this, the partners will determine partial DNA sequences of between 500 and 1000 clones from each of the eight selected salmon tissues, which will be termed expressed sequence tags (ESTs). Homology searches will be performed between the salmon ESTs and DNA sequences deposited in the international DNA databases to identify as many salmon ESTs as genes as proves possible. The SALGENE partners will also perform tissue expression analysis on selected ESTs of interest to determine tissue expression profile data.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Informatik und Informationswissenschaften Datenbank
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik RNS
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Daten nicht verfügbar
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
90 GALWAY
Irland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.