Obiettivo
To isolate and identify new genes from Atlantic salmon using a strategy based on cloning expressed sequence tags (ESTs).
Messenger RNA (mRNA) will be prepared from nine adult salmon tissues (i.e. male and female gonad, liver, spleen, kidney, intestine, gill, brain, muscle) and used to generate cDNA libraries. Other tissues from salmon challenged with pathogens and salmon that are immuno-stimulated will also be included. Clones will be selected representing the abundant and rare mRNA transcripts in each library and 400-600 bp of their DNA sequence will be elucidated. Between 500 and 1000 ESTs will be determined from each tissue, resulting in a detailed identification of the genes that are transcriptionally active in each chosen tissue. Selected ESTs (a minimum of 50 per partner), representing the most abundant mRNAs in each respective tissue and mRNAs of particular interest based on homology searches in the international databases, will be tested for their tissue specific expression patterns among other salmon tissues.
RESEARCH TASKS
The SALGENE partners will prepare poly(A) messenger RNA (mRNA) from the chosen salmon tissues and construct complementary DNA (cDNA) libraries using molecular genetic methods. Following this, the partners will determine partial DNA sequences of between 500 and 1000 clones from each of the eight selected salmon tissues, which will be termed expressed sequence tags (ESTs). Homology searches will be performed between the salmon ESTs and DNA sequences deposited in the international DNA databases to identify as many salmon ESTs as genes as proves possible. The SALGENE partners will also perform tissue expression analysis on selected ESTs of interest to determine tissue expression profile data.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali informatica e scienze dell'informazione basi di dati
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Dati non disponibili
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
90 GALWAY
Irlanda
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.