Objetivo
Research objectives and content
HMG-D is one the Drosophila counterparts of the mammalian HMG- 1 and 2 chromosomal proteins. These proteins are abundant but their functions are not well understood. HMG-D comprises a single HMG domain, which is the primary DNA binding motif, followed by a basic region and a C-terminal acidic tail. This acidic tail confers selectivity for the recognition of deformed DNA structures, such as bulged DNA and four-way junctions, and thereby modulates the binding of the protein to DNA. On the basis of footprinting studies it is proposed that HMG-D recognises a widened minor groove in such deformed structures and that a major determinant of this selective recognition is the loop connecting helices I and II. I plan to test this hypothesis by biochemical studies on the complex of HMG-D with bulged DNA and by designing and testing model peptides for bulged DNA recognition. The major goal of this project is to determine the solution structure of the complex of HMG-D with bulged DNA by NMR spectroscopy and in addition to determine whether the structure of the HMG domain is modulated by the acidic tail.
Training content (objective, benefit and expected impact)
Although the proposed project is in the same general area as my PhD work, in practice it will involve a substantial extension to my skills. The HMG system is significantly more demanding technically than AlcR (the subject of my PhD project), both because optimum conditions for the NMR experiments are much harder to establish, and because 13C labelling and triple resonance experiments will be required for me to complete the structure determination. It will be of great value for me to develop the necessary skills for this project in the context of a world-leading NMR group.
Links with industry / industrial relevance (22)
no link with industry
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias físicas óptica espectroscopia espectroscopia de absorción
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
CB2 2QH Cambridge
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.