Cel
Research objectives and content
HMG-D is one the Drosophila counterparts of the mammalian HMG- 1 and 2 chromosomal proteins. These proteins are abundant but their functions are not well understood. HMG-D comprises a single HMG domain, which is the primary DNA binding motif, followed by a basic region and a C-terminal acidic tail. This acidic tail confers selectivity for the recognition of deformed DNA structures, such as bulged DNA and four-way junctions, and thereby modulates the binding of the protein to DNA. On the basis of footprinting studies it is proposed that HMG-D recognises a widened minor groove in such deformed structures and that a major determinant of this selective recognition is the loop connecting helices I and II. I plan to test this hypothesis by biochemical studies on the complex of HMG-D with bulged DNA and by designing and testing model peptides for bulged DNA recognition. The major goal of this project is to determine the solution structure of the complex of HMG-D with bulged DNA by NMR spectroscopy and in addition to determine whether the structure of the HMG domain is modulated by the acidic tail.
Training content (objective, benefit and expected impact)
Although the proposed project is in the same general area as my PhD work, in practice it will involve a substantial extension to my skills. The HMG system is significantly more demanding technically than AlcR (the subject of my PhD project), both because optimum conditions for the NMR experiments are much harder to establish, and because 13C labelling and triple resonance experiments will be required for me to complete the structure determination. It will be of great value for me to develop the necessary skills for this project in the context of a world-leading NMR group.
Links with industry / industrial relevance (22)
no link with industry
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- nauki przyrodnicze nauki fizyczne optyka spektroskopia spektroskopia absorpcyjna
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Brak dostępnych danych
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
CB2 2QH Cambridge
Zjednoczone Królestwo
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.