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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2022-12-23

Comparative structural analysis of genomic DNA

Ziel



For the understanding of the basic DNA-structure, and thus its organisation and regulation, sequence comparisons between different species are a prerequisite. Studies of this kind provide information on the distribution, frequency and variation of DNA-features and form the basis for experiments on their relevance to functions. Knowledge of the ubiquity (or rarity) and similarity of particular, regulative DNA-structures, for instance, could permit a directed influence on a certain group of cell-functions.

As a pilot project aimed at the refinement of the relevant procedures, so that eventually large DNA-segments or even entire chromosomes or genomes can be examined, a genomic region known to be homologous in the fruit fly Drosophila melanogaster, the nematode Caenorhabditis elegans, mouse and human will be studied. The genomic regions around the conserved homologues of the Drosophila melanogaster flightless-(fliI) gene in the above organisms will be used initially. The human region is of particular interest, since three distinct inherited chromosomal anomalies map to this chromosomal area. Genomic clones and cDNAs of the fliI homologues will be hybridised with short oligomer sequences, that is hexamer to decamer oligonucleotides, whereby a partial sequence of the studied DNA fragments is obtained.

Complementary experiments will be carried out with either the oligomers or the DNA fragments presented on a support matrix in the form of an ordered array. Already with randomly chosen oligomers, comparisons can be made based on a statistical analysis of frequency, combination and intensity of oligomer binding. Using also selected oligonucleotides resembling sequence motifs, data obtained from such experiments directly provide information on the DNA structure, such as the position and kind of repeats or regulatory elements. Thus, the DNA segments will not only be compared but simultaneously they can be assessed on the basis of this partial sequence information before any further work-intensive and costly complete sequence analyses are carried out. In addition to the fliI locus, further DNA regions, such as variable regions of mitochondria or the p53 gene, will be worked on at later stages of the project.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

Daten nicht verfügbar

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

Daten nicht verfügbar

Koordinator

Deutsches Krebsforschungszentrum
EU-Beitrag
Keine Daten
Adresse
Im Neuenheimer Feld 280
69120 Heidelberg
Deutschland

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Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten

Beteiligte (2)

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