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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2024-05-27

The eukaryotic linear motif resource, elm: a new european bioinformatics facility for revealing functional sites in modular proteins

Ziel

Reflecting the moduiar nature of eucharistic proteins, several WWW servers (e.g. PFAM, SMART, PROSITE) are dedicated to revealing domains in protein sequences: These servers have become indispensable bio informatics tools. However, there is no resource, which specifically focuses on short functional motifs (targeting peptides. docking modules. phosphorylation sites etc.). Yet these modules are Justas important for function as the larger protein domains. The reason there are no good tools is that the notify are so short that they severely over predict, only acquiring significance in the right context (e.g. KDEL functions in the ER compartment). We will address this deficit by creating and applying ELM, a comprehensive set of tools for evaluating linear notify in eukaryotlc proteins using context-based rules to reduce or eliminate false positives. ELM will be available via the www and in a package for automated genome analysis pipelines.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

Daten nicht verfügbar

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

CSC - Cost-sharing contracts

Koordinator

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
EU-Beitrag
Keine Daten
Adresse
Meyerhofstrasse 1
69012 HEIDELBERG
Deutschland

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Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten

Beteiligte (5)

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