Análisis de microarrays para detectar interacciones virus-hospedador
El VHC es un virus de ARN de cadena sencilla que está asociado con la inflamación crónica del hígado, la fibrosis y la formación de tumores hepáticos. El virus se replica dentro de las células mediante la interacción con las membranas de las células huésped, posiblemente a través de proteínas no estructurales. Sin embargo, tanto el mecanismo preciso de ensamblaje como el mantenimiento de la replicación del complejo ARN siguen siendo en gran parte desconocidos. Los investigadores del proyecto financiado por la Unión Europea «Mapping of Hepatitis C virus NS4B protein interactions with its host network» (HCV PATHOLOGY) determinaron que el mapeo de la interacción entre proteínas virales con proteínas de las células huésped proporcionaría información clave sobre el ciclo vital del virus. Además, esto ayudaría a identificar dianas moleculares con potencial uso terapéutico. Para hacer frente a las limitaciones técnicas existentes para estudiar las interacciones de las proteínas virales con las células huésped, el equipo de trabajo del proyecto HCV PATHOLOGY desarrolló un array de proteínas basado en microfluídos. La plataforma combinó microarrays con la expresión de proteínas in vitro de una biblioteca de más de trece mil genes sintéticos. Se imprimieron un total de diez mil proteínas humanas en el chip y estas sirvieron como dianas para ensayos de unión con proteínas virales. Empleando este sistema, los investigadores identificaron novedosos ligandos de la proteasa NS3 del VHC. Este hecho tiene importantes implicaciones terapéuticas, ya que el bloqueo de proteasas es uno de los métodos de referencia para la terapia antiviral. Gracias a diferentes colaboraciones científicas, la plataforma de microfluidos desarrollada por el proyecto HCV PATHOLOGY podría ser empleada para caracterizar otras interacciones de proteínas virales o proporcionar respuestas para cuestiones biológicas clave.
Palabras clave
Virus de la hepatitis C, antiviral, interacciones de proteínas, proteasa NS3, plataforma de microfluidos