Mikromacierze wykrywają oddziaływania wirus-gospodarz
Wirus HCV jest małym wirusem RNA, który wywołuje przewlekłe zapalenie wątroby, zwłóknienia i guzy tego narządu. Wirus ulega replikacji wewnątrz komórek przez oddziaływanie z błonami gospodarza, prawdopodobnie dzięki bezpostaciowym białkom. Jednakże dokładny mechanizm tworzenia i podtrzymywania kompleksu replikacyjnego RNA jest słabo poznany. Naukowcy z finansowanego przez UE projektu "Mapping of Hepatitis C virus NS4B protein interactions with its host network" (HCV PATHOLOGY) sądzą, że mapowanie oddziaływań białek wirusowych z białkami gospodarza powinno rzucić światło na cykl życiowy wirusa. Co więcej pomoże to w identyfikacji celów molekularnych o potencjalnym znaczeniu terapeutycznym. Aby przezwyciężyć istniejące ograniczenia techniczne w poznawaniu oddziaływań białek wirusowych w komórkach gospodarza, zespół HCV PATHOLOGY stworzył macierz białkową bazującą na platformie mikrocieczowej. Platforma łączy mikromacierze z ekspresją białek in vitro z biblioteki zawierającej ponad 13 000 sztucznych genów. W sumie 10 000 ludzkich białek zostało naniesionych na chip i posłużyło do oznaczania połączeń z białkami wirusowymi. Korzystając z powyższego systemu naukowcy zidentyfikowali nowe białka ludzkie łączące się z proteazą NS3 wirusa HCV. Ma to potencjalne znaczenie terapeutyczne, ponieważ blokowanie proteazy jest jednym z mechanizmów działania stosowanych leków antywirusowych. Dzięki współpracy naukowej platforma mikrocieczowa zespołu HCV PATHOLOGY może zostać użyta do scharakteryzowania innych oddziaływań białek wirusowych lub dostarczyć odpowiedzi na kluczowe biologiczne pytania.
