Mikromacierze wykrywają oddziaływania wirus-gospodarz
Wirus HCV jest małym wirusem RNA, który wywołuje przewlekłe zapalenie wątroby, zwłóknienia i guzy tego narządu. Wirus ulega replikacji wewnątrz komórek przez oddziaływanie z błonami gospodarza, prawdopodobnie dzięki bezpostaciowym białkom. Jednakże dokładny mechanizm tworzenia i podtrzymywania kompleksu replikacyjnego RNA jest słabo poznany. Naukowcy z finansowanego przez UE projektu "Mapping of Hepatitis C virus NS4B protein interactions with its host network" (HCV PATHOLOGY) sądzą, że mapowanie oddziaływań białek wirusowych z białkami gospodarza powinno rzucić światło na cykl życiowy wirusa. Co więcej pomoże to w identyfikacji celów molekularnych o potencjalnym znaczeniu terapeutycznym. Aby przezwyciężyć istniejące ograniczenia techniczne w poznawaniu oddziaływań białek wirusowych w komórkach gospodarza, zespół HCV PATHOLOGY stworzył macierz białkową bazującą na platformie mikrocieczowej. Platforma łączy mikromacierze z ekspresją białek in vitro z biblioteki zawierającej ponad 13 000 sztucznych genów. W sumie 10 000 ludzkich białek zostało naniesionych na chip i posłużyło do oznaczania połączeń z białkami wirusowymi. Korzystając z powyższego systemu naukowcy zidentyfikowali nowe białka ludzkie łączące się z proteazą NS3 wirusa HCV. Ma to potencjalne znaczenie terapeutyczne, ponieważ blokowanie proteazy jest jednym z mechanizmów działania stosowanych leków antywirusowych. Dzięki współpracy naukowej platforma mikrocieczowa zespołu HCV PATHOLOGY może zostać użyta do scharakteryzowania innych oddziaływań białek wirusowych lub dostarczyć odpowiedzi na kluczowe biologiczne pytania.
Słowa kluczowe
Wirus WZW typu C, antywirusowy, oddziaływania białek, proteaza NS3, platforma mikrocieczowa