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Investigation into the Biological Cost and Adaptation of the Host to Antibiotic Resistance on mobile Genetic Elements in Enterococcus species

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La résistance aux antibiotiques et le déclin de la forme physique

La résistance aux antibiotiques chez les bactéries est l'un des plus grands défis de la médecine moderne. Un projet de l'UE s'est penché sur les effets d'une méthode visant à insérer des gènes de résistance dans les bactéries elles-mêmes et son importance pour la gestion de la résistance antimicrobienne.

La propagation de la résistance aux antibiotiques entre les différentes populations bactériennes représente un phénomène inquiétant. Le transfert horizontal de gènes est responsable du mouvement des éléments génétiques mobiles qui peuvent contenir des gènes pour la résistance aux antimicrobiens. Un de ces gènes transférables, le transposon conjugatif (Tnc), Tn916, a été découvert dans de nombreuses bactéries. Tn916 est responsable de la résistance à la tétracycline et à d'autres agents antimicrobiens. Le projet BIOCHARGE financé par l'UE s'est penché sur le genre des entérocoques, généralement présent dans les intestins de l'homme et des animaux. Il existe plus de 17 espèces, mais E. faecalis et E. faecium provoquent fréquemment des infections chez l'homme. On sait que l'acquisition de la résistance aux antibiotiques entraîne un déclin de la forme physique chez la bactérie. En se concentrant sur la diversité du Tn916, les scientifiques se sont penchés sur la façon dont le transfert de l'élément génétique affecte la survie dans 100 souches résistantes à la tétracycline, dont 7 différentes souches d'entérocoque. Les chercheurs ont utilisé la réaction de polymérase en chaîne pour amplifier les Tnc comme Tn916 et ont appliqué ensuite une analyse par RFLP (restriction fragment length polymorphism). La diversité de Tn916 était considérablement faible dans la centaine de souches originaires de la Chine, du Danemark, d'Angleterre, du Portugal, d'Espagne, de Suède et des États-Unis. Dans d'autres genres tels que le Streptococcus oral, la variation de ces éléments est beaucoup plus élevée. En observant les taux de croissance des bactéries porteuses de Tn916 et un autre transposon de la même famille, Tn6000, les scientifiques ont découvert des coûts d'énergie importants pour les bactéries. Pour Tn6000, les coûts d'énergie se situaient à seulement environ 3 %, mais pour Tn916 ce taux s'élevait à 16,7 %. Une recherche approfondie a révélé que lorsque les bactéries intègrent d'abord Tn916, le coût d'énergie est vraiment élevé; soit jusqu'à 46 %. Cependant, après seulement 700 générations en l'absence de tétracycline, le coût énergétique s'est réduit, ce qui explique la prévalence élevée de Tn916 mondialement. À l'aide d'une mutation de désactivation, les chercheurs ont également découvert que la stabilité de l'unité de résistance était systématiquement de 100 %. Les résultats de BIOCHARGE montrent que les bactéries peuvent s'adapter à la perte d'énergie après l'acquisition de gènes de résistance en un laps de temps très court. Les gènes de résistance demeurant stables dans l'espèce des entérocoques, et ainsi, l'arrêt de l'utilisation répandue de la tétracycline ne semble pas réduire l'incidence de ce type de résistance.

Mots‑clés

Résistance aux antibiotiques, gestion de la résistance, tétracycline, Enterococcus, santé biologique

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