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Global cooperation to develop next generation whole genome SEQuence SELection tools for novel traits

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Exploración del genoma de las vacas lecheras

La Unión Europea está favoreciendo una mayor eficiencia en la producción de alimentos a escala global por medio del aprovechamiento de información genómica de última generación.

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El proyecto SEQSEL (Global cooperation to develop next generation whole genome sequence selection tools for novel traits) ha establecido lazos de colaboración en materia científica entre socios de gran prestigio mundial de Europa, Australia y Nueva Zelanda. Juntos han analizado el genoma bovino con el objetivo de identificar regiones asociadas con la ingesta de alimento y la eficacia de la alimentación en el ganado bovino. El intenso intercambio de ideas y el gran esfuerzo conjunto permitió alcanzar la conclusión de que la medida más apropiada para evaluar la eficacia de la alimentación en los programas de cría depende en gran medida del país en cuestión. Es más, los datos de SEQSEL han revelado que el análisis de la leche mediante espectroscopía en el infrarrojo medio constituye el método más adecuado para evaluar con precisión la eficacia de la alimentación. El consorcio recopiló información referente a la ingesta de alimento (fenotipo) y el ADN (genotipo). En total se compararon y se analizaron más de doscientos veinticuatro mil registros sobre la ingesta de alimento de cerca de siete mil vacas y de mil ochocientas terneras. Cabe destacar que los datos procedían de nueve países. Sin duda, esta es la mayor base de datos creada a escala internacional sobre la ingesta de alimento en el ganado vacuno lechero. Los resultados señalan que, de media, el 34 % de la variación en la ingesta de alimento es debida a características genéticas (genotipo) y, por tanto, susceptible a la selección genética. Es más, un análisis para detectar la frecuencia de las interacciones entre el genotipo y el ambiente entre poblaciones (es decir, para determinar si las diferencias entre animales son dependientes del entorno) puso de manifiesto que efectivamente existen diferencias, especialmente entre poblaciones de ganado vacuno lechero de sistemas de pastoreo y poblaciones de sistemas de producción confinada. El intercambio de datos genéticos y la predicción del genotipo revelaron que el valor de la precisión de los análisis de imputación de datos genéticos era aproximadamente del 97 %. Las implicaciones económicas de este hecho es que la secuenciación del ADN completo de una sola vaca costará aproximadamente 22 euros en comparación con los 1 500 euros de la secuenciación convencional. Los resultados del proyecto han sido ampliamente difundidos a escala nacional y global. En este sentido, se han publicado varios artículos en las revistas científicas con revisión por pares Journal of Dairy Science y Genetic Selection Evolution. Además, los socios del proyecto han dado charlas en simposios internacionales de gran prestigio, incluyendo el X Congreso Mundial de Genética Aplicada a la Producción Pecuaria. Los resultados del proyecto SEQSEL demuestran claramente que la colaboración y la recopilación e intercambio de grandes conjuntos de datos tienen un beneficio sin precedentes. Es más, estos tendrán, importantes consecuencias de cara a afrontar el problema del incremento mundial de la demanda de alimentos y seguridad alimentaria debido a una población en constante crecimiento y a una disminución de la superficie destinada a tierras de cultivo.

Palabras clave

Genoma, vacas lecheras, SEQSEL, ingesta de alimento, leche, espectroscopía en el infrarrojo medio, seguridad alimentaria

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