Reconstruire l'industrie ostréicole d'Europe
L'huître plate, Ostrea edulis, est une espèce originaire d'Europe qui fait partie de l'alimentation humaine depuis très longtemps. Suite à sa surexploitation au début du XXe siècle, la population a fortement diminué sans se restaurer en raison d'une infection parasite et suite aux nombreux échecs d'endiguement. La production reste donc faible, et influence économiquement l'industrie ostréicole européenne. La priorité pour cette dernière est d'élever une souche résistante d'huître et de reconstruire ainsi la population. Le projet OYSTERECOVER(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) (Establishing the scientific bases and technical procedures and standards to recover the European flat oyster production through strategies to tackle the main constraint, bonamiosis), financé par l'UE, avait pour objectif d'offrir un fondement scientifique à cette démarche. L'étude concernait le cycle de vie et l'écologie du parasite protozoaire Bonamia ostreae et l'identification des marqueurs phénotypiques et génétiques de la résistance des huîtres pour enfin développer des programmes de sélection génétique durable. Le consortium, composé de 15 membres, s'est attelé à cette tâche pendant les 42 mois du projet, jusqu'en octobre 2013. La recherche a initialement contribué à plusieurs nouvelles approches de diagnostic de l'infection à Bonamia. Vérifiées par trois laboratoires, les techniques microscopiques et moléculaires du projet ont été recommandées pour l'usage général selon des protocoles fixes. OYSTERECOVER a procédé à l'étude du cycle de vie du parasite, en se concentrant notamment sur la progression initiale de l'infection à B. ostrae, les méthodes de transmission et les hôtes potentiels. Ces travaux ont permis l'élaboration de trois recommandations de gestion. Premièrement, il convient d'user de prudence concernant la contamination potentielle des zones infectées aux zones non-infectées. Deuxièmement, l'eau de mer pompée dans les écloseries doit être filtrée. Enfin, des méthodes de détection précoce doivent être appliquées sur les nouvelles livraisons pour détecter toute infection latente. L'analyse du transcriptome des hémocytes des huîtres (les cellules responsables de la neutralisation de la bonamiose) associée à une analyse génétique de la population d'huître a entraîné l'identification de deux gènes candidats comme marqueurs de résistance. Les membres de l'équipe du projet ont développé un outil de système d'information géographique pour une gestion efficace des nids d'huîtres naturels et des exploitations ostréicoles. L'analyse génétique des populations d'huîtres sur la côte Atlantique de l'Europe a révélé trois groupes génétiquement différents; cette variabilité génétique doit être prise en considération à l'heure d'appliquer des programmes de restauration et d'élevage sélectif. Le groupe de chercheurs a aussi étudié l'emploi efficace de collecteurs de naissains, produisant des recommandations supplémentaires pour l'industrie. La réalisation principale du projet a été l'identification des marqueurs phénotypiques et génétiques de résistance à la bonamiose. OYSTERECOVER a déterminé plusieurs facteurs biologiques affectant l'infection parasitique des populations d'huîtres commerciales. Ces travaux constituent un premier pas vers le développement de programmes d'élevage qui pourraient établir de nouvelles variétés résistantes à l'avenir.
