Un modèle de porc pour la suralimentation et l'obésité humaines
Le projet SYSGEN OF OBESITY (Systems genetics of obesity and related metabolic traits in pig model to improve human health) a travaillé sur des porcs spécialement élevés pour étudier la génomique de l'obésité et des maladies associées. Trois générations de croisements de mini-porcs gras de Göttingen génétiquement prédisposés à l'obésité avec des porcs de production qui sont élevés pour être maigres ont produit environ 600 animaux pour l'étude. Les chercheurs ont recueilli des données sur 50 caractéristiques OSMD différentes sur ces 600 porcs. Les porcs ont été phénotypés et génotypés en utilisant des réseaux d'ADN du génome entier. Une biobanque a stocké 24 types d'échantillons de tissus différents, du sang pour l'extraction de l'ADN, ainsi que des matières fécales et de l'urine congelée de tous animaux. Toutes les données ont ensuite été analysées en utilisant les méthodes de génétique et de bioinformatique statistiques de pointe pour quantifier les différences génétiques entre les porcs et pour identifier les gènes et les voies moléculaires pour l'obésité et le comportement alimentaire. Les résultats ont montré une forte variation génétique pour l'obésité. Cela confirme que le croisement a créé une population de ressources avec le potentiel de produire un contexte génétique solide pour les caractères OSMD. La recherche a également découvert de nombreux gènes affectant les phénotypes de l'OMSD. Au total, les chercheurs ont identifié 229 caractéristiques quantitatives associées à des phénotypes adipeux et métaboliques à des niveaux importants du génome. Plusieurs gènes candidats dans 18 de ces régions influencent l'indice de masse corporelle et les traits associés au profil lipidique. Le développement de ces résultats a identifié des gènes et des biomarqueurs hautement prédictifs chez les humains avec OSMD en comparant la biologie et la génomique des systèmes porcs-humain. La combinaison du profilage des voies métaboliques pourrait révéler des mécanismes responsables aux différences individuelles relatives au développement de l'OMSD. L'équipe de SYSGEN OF OBESITY a également intégré les données de transcriptome de plus de 22 000 gènes avec quelque 60 000 marqueurs d'ADN pour trouver les coupables génétiques derrière l'OSMD. À l'aide d'une approche génétique des systèmes intégrés, les chercheurs ont également examiné les mécanismes impliqués dans ces troubles métaboliques. Des journaux tels que PLoS One, Genome Medicine, BMC Systems Biology et BMC Medical Genomics ont présenté les résultats de la recherche pour toutes les caractéristiques liées à l'obésité telles que le poids, la croissance, la graisse corporelle et la composition corporelle. De grands journaux ont ensuite suivi avec des articles, l'original étant Why Do Humans Pig Out(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre).
