Badanie przejadania się i otyłości u ludzi na przykładzie świń
W ramach projektu SYSGEN OF OBESITY (Systems genetics of obesity and related metabolic traits in pig model to improve human health) prowadzone są prace na specjalnie wyhodowanych świniach, które ujawnią genomikę otyłości i chorób pokrewnych. Trzy pokolenia krzyżowania tłustych miniaturowych świnek getyńskich, genetycznie predysponowanych do otyłości, ze świnią hodowlaną przeznaczoną na chude mięso pozwoliły uzyskać blisko 600 sztuk świń do badania. Naukowcy zgromadzili dane na temat 50 różnych cech OMSD tych 600 świń. Przeprowadzono fenotypowanie i genotypowanie zwierząt z użyciem testów całego genomu. W biobanku przechowywane były próbki tkanki 24 różnych typów, krew do ekstrakcji DNA oraz zamrożone odchody i próbki moczu. Następnie przeanalizowano wszystkie dane przy wykorzystaniu najnowocześniejszej metod genetyki statystycznej oraz bioinformatyki, aby ilościowo ocenić różnice genetyczne między świniami oraz aby zidentyfikować geny i szlaki molekularne związane z otyłością i zachowaniami żywieniowymi. Wyniki pokazują znaczną zmienność genetyczną w przypadku otyłości. To potwierdza, że w wyniku hodowli krzyżowej stworzono populację zdolną do wyprodukowania solidnego tła genetycznego umożliwiającego obserwację cech OMSD. Badanie ujawniło także wiele genów oddziałujących na fenotypy OMSD. W sumie naukowcy zidentyfikowali 229 loci cech ilościowych związanych z otyłością i fenotypami metabolicznymi na poziomie zauważalnym z punktu widzenia całego genomu. Kilka genów w 18 spośród tych regionów potencjalnie wpływa na wskaźnik masy ciała (BMI) i cechy otyłości. Dalsza analiza tych wyników doprowadziła do zidentyfikowania genów i biomarkerów prognostycznych u osób cierpiących na OMSD, poprzez porównanie systemów biologicznych oraz genomicznych świni i człowieka. Połączenie z profilowaniem szlaku metabolicznego może ujawnić złożone mechanizmy, które dadzą początek indywidualnym różnicom w rozwoju OMSD. Zespół projektu SYSGEN OF OBESITY zintegrował również dane transkryptomiczne z ponad 22 000 genów z 60 000 markerami DNA, aby znaleźć genetyczne podłoże OMSD. Przy użyciu zintegrowanych metod genetyki systemów naukowcy zbadali również mechanizmy związane z tymi zaburzeniami metabolicznymi. Prestiżowe czasopisma, takie jak PLoS One, Genome Medicine, BMC Systems Biology oraz BMC Medical Genomics, opublikowały wyniki badań nad wszystkimi związanymi z otyłością cechami, takimi jak masa ciała, wzrost, poziom tkanki tłuszczowej i skład ciała. Liczące się czasopisma opublikowały na ten temat różne artykuły, których pierwowzorem jest publikacja pt. Dlaczego ludzie obżerają się jak świnie?(odnośnik otworzy się w nowym oknie)
