Le silençage des ARN du noyau
L'objectif du projet NONCODOWN (Optimizing antisense oligonucleotides for efficient and specific knockdown of nuclear non-coding RNA), financé par l'UE, était de développer la meilleure technique pour désactiver (silencer) des ARN du noyau. Les scientifiques ont appliqué les techniques les plus réussies du domaine de la chimie de l'acide nucléique. Ils se sont fondés sur l'acide nucléique bloqué (LNA), également connu comme ARN inaccessible, et les oligonucléatides antisens (ASO), appelés gapmères. Ils ont également développé de nouveaux concepts d'oligomères chimériques d'acide nucléique peptidique (PNA)-DNA-LNA pour dégrader les cibles ARN structurées. Une série d'ASO optimisés a été développée pour cibler et dégrader les ARN structurés. Cela a été obtenu en intégrant une séquence partielle de PNA et partie de l'ADN, unis par un nucléotide conformationnellement bloqué. Les concepts chimiques ont été comparés en matière de silençage d'un transcript d'ARN nucléaire et incluaient les ARN de silençage (ARNsi), des ARNsi à simple branche et les ASO modifiés par LNA. Les chercheurs ont découvert que les ASO étaient les plus efficaces pour mener à bien cette tâche. NONCODOWN a également examiné des oligonucléotides chimiquement modifiés comme LNA et PNA par rapport à leur capacité à bloquer l'action d'un ARNnc non-codant régulateur bactérien. Ils ont également servi à identifier des inhibiteurs potentiels.
Mots‑clés
ARN non-codant, NONCODOWN, silençage des ARN, acide nucléique bloqué, oligonucléotides antisens, acide nucléique peptidique