RNA nucleari silenziatori
L’obiettivo del progetto NONCODOWN (Optimizing antisense oligonucleotides for efficient and specific knockdown of nuclear non-coding RNA), finanziato dall’UE, era sviluppare la tecnologia migliore per disattivare (silenziare) gli RNA nucleari. Gli scienziati hanno applicato le tecniche di maggior successo dal campo della chimica degli acidi nucleici, basate su acido nucleico bloccato (LNA), noto anche come RNA inaccessibile, e oligonucleotidi antisenso (ASO), detti GAPMER. Sono stati sviluppati anche nuovi progetti di oligomeri chimerici di acido peptido nucleico (PNA)-DNA-LNA per degradare RNA strutturati target. Una serie di ASO ottimizzati è stata sviluppata per bersagliare e degradare RNA strutturati. Ciò si è ottenuto includendo una sequenza parziale di PNA e una parte di DNA, unite da un nucleotide con conformazione bloccata. I progetti chimici sono stati confrontati per il silenziamento di trascritto di RNA contenuto nel nucleo e includevano RNA silenziatori (siRNA), siRNA a singolo filamento e ASO modificati con LNA. I ricercatori hanno scoperto che gli ASO erano i più efficaci nello svolgimento di questo compito. NONCODOWN ha anche eseguito uno screening degli oligonucleotidi modificati chimicamente come LNA e PNA rispetto alla loro capacità di bloccare l’azione di un ncRNA regolatore batterico. Sono stati utilizzati anche per identificare potenti inibitori.
Parole chiave
RNA non codificante, NONCODOWN, RNA silenziatori, acido nucleico bloccato, oligonucleotidi antisenso, acido peptido nucleico
