La función y la evolución de las moléculas de ARN no codificante de cadena larga
Los ARNncl son un grupo heterogéneo de moléculas de ARN relacionadas con muchos procesos biológicos, incluyendo la inhibición de los cromosomas sexuales, la impronta genética y la regulación de la expresión génica. Actualmente, los ARNncl son el grupo menos conocido de transcritos genómicos. Por tanto, el objetivo de la iniciativa financiada por la Unión Europea EVOLNCRNAS (The origin and functional evolution of long non-coding RNAs) era estudiar aspectos básicos de la biología de los ARNncl. Los investigadores se centraron en el estudio de la expresión de los ARNncl durante el desarrollo en mamíferos. En este contexto, estos generaron una fuente de información transcriptómica a gran escala que abarca el desarrollo de los principales linajes de mamíferos. El objetivo era comprender mejor la síntesis de estos transcritos genómicos y determinar su función y participación en la evolución del genoma de mamíferos. Los investigadores generaron perfiles de expresión génica para nueve órganos clave (cerebro, cerebelo, hígado, corazón, riñones, ovarios, testículos, placenta y decidua) durante el desarrollo de machos y hembras de siete especies de mamíferos, incluyendo al ser humano, la rata y el pollo, entre otros. El muestreo comenzó tan pronto como los órganos en estado primordial podían ser identificados y continuó hasta la madurez a diferentes puntos temporales del desarrollo. Este conjunto de datos proporcionó un perfil de expresión génica único a lo largo del desarrollo en mamíferos. Empleando estas bibliotecas, los investigadores primero identificaron los grupos de ARNncl que se expresan durante el desarrollo y aquellos que están regulados por el desarrollo y, seguidamente, los compararon con algunos reguladores conocidos como, por ejemplo, los factores de transcripción. La comparación de la expresión del ARNncl con la expresión de genes codificadores de proteínas, cuyas funciones son conocidas, permitió predecir aquellas funciones del ARNncl que están relacionadas con el desarrollo. Es más, los investigadores identificaron determinados ARNncl que, junto con genes codificadores de proteínas, son responsables de las diferencias fenotípicas observadas entre especies de mamíferos. Este estudio basado en un contexto del desarrollo puso de manifiesto las funciones potenciales de grandes conjuntos de genes como reguladores y contribuidores capitales de los fenotipos de mamíferos. Finalmente, los miembros del proyecto estudiaron la expresión del ARNncl durante el desarrollo de la placenta en seis especies de mamíferos y en un conjunto de treinta placentas humanas. Se espera que los resultados del proyecto ayuden a correlacionar la expresión del ARNncl con diferentes morfologías de la placenta y resultados del embarazo.
Palabras clave
ARN no codificante de cadena larga, EVOLNCRNAS, desarrollo en mamíferos, transcriptómica, placenta
