La technologie des grilles vient en aide à un projet de recherche européen sur le cancer
Le projet CancerGrid récemment lancé rassemblera des partenaires provenant de l'industrie et du monde universitaire à l'occasion de la première application à grande échelle de technologie de grille informatique pour découvrir et mettre en place de nouveaux agents anti-cancer. Le programme de recherche multidisciplinaire financé par l'UE et d'une durée de trois ans visera à associer les nouvelles technologies à la biologie afin d'enrichir les librairies de molécules et d'accroître les chances de découvrir des médicaments pouvant éventuellement guérir du cancer. «Ce projet innovant utilise une technologie informatique basée sur les grilles pour la conception automatisée de librairies chimiques, dans le but de découvrir d'éventuels traitements du cancer», a déclaré Michael Guaciaro, Docteur en philosophie, président et chef de gestion d'AMRI, l'un des partenaires industriels du projet. Le projet emploiera des ressources d'informatique de grille afin de permettre aux chercheurs d'accéder à un réseau puissant de stations de travail interconnectées capables de traiter de grandes quantités de données et de réduire le temps informatique. Selon l'Organisation mondiale de la santé, le cancer affecte des millions de personnes et représente 13 % des décès à travers le monde. Dans le génome humain, on estime à environ 3000 gènes le sous-ensemble qui encode les protéines, y compris les nouvelles cibles reliées au cancer, qui pourraient être régulées avec des molécules identiques aux médicaments. Les partenaires du projet travailleront sur la mise au point de collections spécifiques de composés chimiques (librairies chimiques «ciblées») qui interagissent avec ces protéines de cancer. «Notre objectif est de mettre au point des méthodes pour créer des librairies chimiques contenant des molécules actives contre les nouvelles cibles émergentes de cancer», a expliqué Gyorgy Dorman, responsable en sciences et technologie de l'AMRI. «L'utilisation de la technologie soutenue par la grille devrait accroître de façon substantielle la possibilité de découvrir de nouvelles têtes de série anti-cancer, ainsi que d'accroître le passage de la connaissance de base à une étape d'application », a-t-il ajouté. Le projet devrait également produire et valider une technologie pour une conception in silico de librairies et modèles chimiques qui prédisent la toxicité et la spécificité de la cible. Une fois mises au point, ces librairies seront théoriquement applicables à quelconque projet de découverte de médicament.