Technologia gridowa ma pomóc w realizacji europejskiego projektu dotyczącego badań nad rakiem
Niedawno uruchomiony projekt CancerGrid zgromadzi partnerów z przemysłu i środowiska akademickiego przy pierwszym zastosowaniu na dużą skalę komputerowej technologii gridowej do poszukiwania i opracowywania nowych leków przeciwnowotworowych. Celem tego trzyletniego programu badawczego o charakterze wielodyscyplinarnym, finansowanego przez UE, będzie połączenie nowych technologii z biologią i wzbogacenie bibliotek molekularnych, a dzięki temu zwiększenie prawdopodobieństwa odkrycia potencjalnego leku przeciwnowotworowego. - Ten innowacyjny projekt wykorzystuje komputerowe technologie gridowe do zautomatyzowanego projektowania bibliotek związków chemicznych z myślą o odkryciu potencjalnych metod leczenia raka - powiedział dr Michael Guaciaro, prezes i dyrektor zarządzający AMRI, jednego z uczestniczących w projekcie partnerów, którzy wywodzą się ze środowiska przemysłowego. W ramach projektu zostaną użyte środki obliczania gridowego w celu umożliwienia naukowcom wykorzystania potężnej sieci połączonych ze sobą stacji roboczych, która pozwala na przetwarzanie olbrzymich ilości danych i skrócenie czasu obliczeń. Według Światowej Organizacji Zdrowia na raka zapadają miliony ludzi i jest on przyczyną około 13 procent zgonów na całym świecie. W ludzkim genomie znajduje się podzbiór szacowany na około 3000 genów kodujących białka, w tym nowe docelowe elementy mające powiązania z rakiem, na które można oddziaływać molekułami lekopodobnymi. Partnerzy uczestniczący w projekcie będą zajmowali się opracowywaniem specjalnych zbiorów związków chemicznych ("ukierunkowanych" bibliotek związków chemicznych), które oddziałują ze wspomnianymi białkami nowotworowymi. - Naszym celem jest opracowanie metod tworzenia bibliotek związków chemicznych, zawierających molekuły oddziałujące na nowo pojawiające się docelowe elementy nowotworowe - wyjaśnił Gyorgy Dorman, szef działu nauki i techniki w AMRI. - Wykorzystanie technologii wspomaganej sieciami gridowymi powinno znacznie zwiększyć prawdopodobieństwo znalezienia nowych przeciwrakowych związków wiodących, jak również częstotliwość przekształcania wiedzy podstawowej w zastosowania - dodał. Oczekuje się, że efektem tego projektu będzie opracowanie i zweryfikowanie technologii projektowania "in silico" bibliotek związków chemicznych i modeli, które posłużą do przewidywania toksyczności i właściwości elementów docelowych. Po opracowaniu biblioteki będzie można teoretycznie wykorzystywać w każdym projekcie związanym z opracowywaniem leków.