Sondeo a fondo de la biomecánica de enfermedades
Los miARN maduran en dos fases siguiendo una ruta en la que están implicados los complejos moduladores del procesamiento Drosha-DGCR8 y Dicer-PACT-TRBP. Estas ribonucleasas son reclutadas por proteínas accesorias multidominio de unión a ARN que interactúan con características estructurales específicas de los miARN inmaduros. El proyecto oncoMiRNA-biogenesis («Biogénesis de microARN oncogénicos: de la estructura de los complejos que modulan el procesamiento de microARN a la inhibición de la maduración de oncogenes humanos») trabaja en un análisis multidisciplinario sobre las redes de interacción biomolecular implicadas en los procesos de producción del miARN humano. Los socios, que se proponen clonar, expresar y cribar dominios solubles extraídos de proteínas modulares de procesamiento, recurrirán a la técnica de resonancia magnética nuclear (RMN) para analizar el plegamiento de ARN y proteínas así como puntos de interacción entre proteínas y ARN. Los experimentos van encaminados a definir la función de las proteínas de biogénesis, describir los mecanismos de reconocimiento de ARN y obtener la primera imagen de resolución atómica de los complejos que modulan el procesamiento de miARN. De este modo se espera sentar las bases para el diseño y el ensayo de inhibidores de la biogénesis de miARN con el fin de descubrir un modo de desentrañar la función de miARN o bien posibles terapias contra el cáncer. Hasta la fecha, el equipo de este proyecto financiado por la Unión Europea ha identificado potenciales construcciones de dominios a partir de proteínas multidominio implicadas en la producción de miARN. También han elaborado un diseño inicial de construcciones a partir de proteínas accesorias implicadas en la biogénesis de miARN. Además, los socios han efectuado ensayos automáticos de clonación y expresión, han realizado análisis biofísicos y mediante espectroscopia por RMN acerca de características concretas de los procesos de biogénesis de miARN, y han optimizado la producción in vitro de miARN. Otros logros del proyecto son el análisis de ciertas interacciones inter e intramoleculares, la producción de cantidades en miligramos de ARN para análisis por RMN, y el desarrollo de estrategias de marcaje de isótopos para el análisis por RMN de interfaces biomoleculares. Los socios de oncoMiRNA-biogenesis confían que sus trabajos, que siguen en marcha, acaben haciendo posible un análisis estructural de la maquinaria de biogénesis de miARN y ofreciendo un panorama complejo de las interacciones proteína-proteína y proteína-ARN mediante espectroscopia por RMN y otras técnicas biológicas. También pretenden desarrollar un modelo de gran resolución con el que describir interacciones e interfaces biomoleculares críticas que intervengan en la biogénesis de miARN.
