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Development of a new diagnostic tool using DNA barcoding to identify quarantine organisms in support of plant health

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Combatir las plagas vegetales en Europa mediante códigos de barras del ADN

Unos investigadores de la Unión Europea han creado una base de datos de códigos de barras del ADN propio de patógenos vegetales. Este recurso, de acceso público, ayudará a prevenir pérdidas económicas relacionadas con las enfermedades que afectan a las plantas.

Cambio climático y medio ambiente icon Cambio climático y medio ambiente

Sólo en la Unión Europea existen casi trescientos organismos en cuarentena que requieren la aplicación de medidas de protección. De cara a identificar patógenos y plagas vegetales de forma precisa, resulta necesario contar con técnicas de diagnóstico especializadas. Recientemente, la técnica del «código de barras del ADN» (DNA barcoding) ha surgido como un método eficaz para la identificación de organismos. En dicho método se utiliza un pequeño fragmento de ADN específico de una especie concreta a modo de código de barras genético. El objetivo del proyecto QBOL, financiado por la UE, fue generar estos códigos de barras específicos para los organismos en cuarentena a fin de crear un método de mantener la salud de las plantas. Para ello, el consorcio obtuvo secuencias génicas de especies incluidas en las listas de la Directiva europea pertinente y de la Organización Europea y Mediterránea de Protección de las Plantas (EPPO). Los científicos confeccionaron varios listados, tanto de organismos en cuarentena como de otras especies que podrían suponer una amenaza para la flora europea en el futuro. Basándose en dichas listas, los investigadores recabaron información genética sobre hongos, bacterias, virus, nematodos y fitoplasmas (un tipo de parásito bacteriano) relevantes. Para cada uno de estos grupos, el equipo de QBOL ensayó con varios códigos de barras de ADN relativos a diversas regiones genéticas y seleccionó los que ofrecían un mayor grado de fiabilidad. Los científicos también probaron una serie de métodos diferentes para extraer ADN y se decantaron por el más efectivo. Esta información, junto con los códigos de barras de ADN escogidos y otros datos taxonómicos complementarios, se introdujo en una base de datos de acceso público. Además, se desarrollaron técnicas de diagnóstico y bioinformáticas basadas en el código de barras del ADN para la correcta identificación de organismos en cuarentena. Una vez creada, la base de datos se vinculó a GenBank, el repositorio de datos genéticos en línea de uso más extendido, así como a otros recursos en Internet. Tras esto, se perfeccionó la base de datos a partir del uso general que se hacía de la misma y de la opinión de los usuarios.

Palabras clave

Código de barras del ADN, patógenos vegetales, organismos en cuarentena, técnicas de diagnóstico, sanidad vegetal

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