Prévoir la toxicité
Par le passé, le respect des exigences réglementaires en matière de toxicologie humaine et environnementale était dû en grande partie à l'expérimentation animale. Le règlement REACH de l'UE portant sur l'enregistrement, l'évaluation, l'autorisation et les restrictions des substances chimiques met désormais l'accent sur des méthodes alternatives. Les relations quantitatives structure à activité (QSAR - Quantitative Structure Activity Relationships) font partie des outils les plus appréciés et de ceux dont l'utilisation est particulièrement encouragée par l'UE. Les modèles QSAR peuvent simuler et prévoir les effets nocifs des substances chimiques sur les cellules, les tissus et l'environnement en fonction de leur similitude à d'autres composés connus dans la base de données type. Des scientifiques européens ont travaillé conjointement sur le projet Opentox («An open source predictive toxicology framework»), financé par l'UE, pour fournir un ensemble d'outils destinés aux évaluateurs de risques toxicologiques. Le cadre facilite l'intégration des données provenant de sources à la fois publiques et confidentielles, de modèles QSAR existants et de bibliothèques pour le développement de nouveaux modèles QSAR. Tous ces outils satisfont également aux exigences réglementaires européennes et internationales et sont présentés dans un format convivial permettant ainsi à ceux qui ne connaissent pas en détail les modèles QSAR de les exploiter. Plusieurs interfaces graphiques ont été développées durant cette période de référence et Opentox a pu être intégré à d'autres plateformes majeures. Par ailleurs, les scientifiques ont ajouté la capacité à convertir le format standard des données de toxicologie existantes dans un format web sémantique. Dans l'ensemble, le partenariat a pu démontrer la souplesse d'utilisation et la capacité d'extension de la plateforme Opentox. Une machine virtuelle Opentox a également été développée, permettant aux utilisateurs de télécharger, d'installer et d'exécuter des applications dans un environnement local. Le cadre Opentox a été évalué avec succès en termes de normes, de ressources, sde ervices et d'applications. Les modules ToxPredict et ToxCreate destinés respectivement à la prévision des effets toxicologiques et à la création d'un modèle pour prévoir la toxicité ont tous deux démontré leur efficacité. Opentox deviendra incontestablement un outil indispensable aux concepteurs de produits chimiques et analystes de la santé et la sécurité et permettre aux patients d'avoir accès à des médicaments plus sûrs.
