Peptide Killers of Bacteria

Información del proyecto

PeptideKillers

Identificador del acuerdo de subvención: 101001470

DOI

10.3030/101001470

Fecha de la firma de la CE 25 Mayo 2021

Fecha de inicio 1 Enero 2022

Fecha de finalización 31 Diciembre 2026

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 2 315 705,00

Aportación de la UE

€ 2 315 705,00

Coordinado por

Masarykova univerzita
Czechia

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Publicaciones

Conference proceedings (1)

HOW LARGE MOLECULES CAN ENTER CELL

Autores: Sukeník Lukáš; Deb Rahul; Vácha Robert
Publicado en: Czech Chemical Society Symposium Series - Annual meeting of the National Institute of Virology and Bacteriology (NIVB), Edición 3, 2022, Página(s) 368
Editor: National Institute of Virology and Bacteriology

Peer reviewed articles (13)

Insertases scramble lipids: Molecular simulations of MTCH2

Autores: Ladislav Bartoš, Anant K. Menon, Robert Vácha
Publicado en: Structure, Edición 32, 2024, Página(s) 505-510.e4, ISSN 0969-2126
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.str.2024.01.012

Pathways to a Shiny Future: Building the Foundation for Computational Physical Chemistry and Biophysics in 2050

Autores: Denys Biriukov, Robert Vácha
Publicado en: ACS Physical Chemistry Au, Edición 4, 2024, Página(s) 302-313, ISSN 2694-2445
Editor: ASC Publications
DOI: 10.1021/acsphyschemau.4c00003

Enhanced diffusion through multivalency

Autores: Ladislav Bartoš, Mikael Lund, Robert Vácha
Publicado en: Soft Matter, Edición 21, 2025, Página(s) 179-185, ISSN 1744-683X
Editor: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4sm00778f

Optimizing properties of translocation-enhancing transmembrane proteins

Autores: Ladislav Bartoš, Martina Drabinová, Robert Vácha
Publicado en: Biophysical Journal, Edición 123, 2024, Página(s) 1240-1252, ISSN 0006-3495
Editor: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2024.04.009

Sequence and structural determinants of RNAPII CTD phase-separation and phosphorylation by CDK7

Autores: Katerina Linhartova, Francesco Luca Falginella, Martin Matl, Marek Sebesta, Robert Vácha, Richard Stefl
Publicado en: Nature Communications, Edición 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-53305-2

Binding of DEP domain to phospholipid membranes: More than just electrostatics

Autores: Francesco L. Falginella, Marek Kravec, Martina Drabinová, Petra Paclíková, Vítĕzslav Bryja, Robert Vácha
Publicado en: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes, Edición Volume 1864, Edición 10, 1 October 2022, 2022, Página(s) 1-12, ISSN 0005-2736
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bbamem.2022.183983

Magainin 2 and PGLa in bacterial membrane mimics IV: Membrane curvature and partitioning

Autores: Enrico F. Semeraro, Peter Pajtinka, Lisa Marx, Ivo Kabelka, Regina Leber, Karl Lohner, Robert Vácha, Georg Pabst
Publicado en: BIOPHYSICAL JOURNAL, Edición Volume 121, Edición 23, 6 December 2022, 2022, Página(s) 4689-4701, ISSN 0006-3495
Editor: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2022.10.018

Amphipathic Helices Can Sense Both Positive and Negative Curvatures of Lipid Membranes

Autores: Peter Pajtinka, Robert Vácha
Publicado en: The Journal of Physical Chemistry Letters, Edición 15, 2024, Página(s) 175-179, ISSN 1948-7185
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.3c02785

Phospholipids are imported into mitochondria by VDAC, a dimeric beta barrel scramblase

Autores: Helene Jahn, Ladislav Bartoš, Grace I. Dearden, Jeremy S. Dittman, Joost C. M. Holthuis, Robert Vácha, Anant K. Menon
Publicado en: Nature Communications, Edición 14, 2023, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43570-y

Membrane Adsorption Enhances Translocation of Antimicrobial Peptide Buforin 2

Autores: Mehrnoosh Khodam Hazrati, Robert Vácha
Publicado en: The Journal of Physical Chemistry B, Edición 128, 2024, Página(s) 8469-8476, ISSN 1520-6106
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.4c04338

Computational Design of Pore-Forming Peptides with Potent Antimicrobial and Anticancer Activities

Autores: Rahul Deb, Marcelo D. T. Torres, Miroslav Boudný, Markéta Koběrská, Floriana Cappiello, Miroslav Popper, Kateřina Dvořáková Bendová, Martina Drabinová, Adelheid Hanáčková, Katy Jeannot, Miloš Petřík, Maria Luisa Mangoni, Gabriela Balíková Novotná, Marek Mráz, Cesar de la Fuente-Nunez, Robert Vácha
Publicado en: Journal of Medicinal Chemistry, Edición 67, 2024, Página(s) 14040-14061, ISSN 0022-2623
Editor: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jmedchem.4c00912

Nanoparticle induced fusion of lipid membranes

Autores: Sofía Blasco, Lukáš Sukeník, Robert Vácha
Publicado en: Nanoscale, Edición 16, 2024, Página(s) 10221-10229, ISSN 2040-3364
Editor: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4nr00591k

Peptide translocation across asymmetric phospholipid membranes

Autores: Ladislav Bartoš, Robert Vácha
Publicado en: Biophysical Journal, Edición 123, 2024, Página(s) 693-702, ISSN 0006-3495
Editor: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2024.02.006

Non-peer reviewed articles (1)

Design guidelines for α-helical peptides that self-assemble into transmembrane barrel pores killing antibiotic-resistant bacteria

Autores: Rahul Deb; Ivo Kabelka; Jan Přibyl; Edo Vreeker; Giovanni Maglia; Robert Vácha
Publicado en: bioRxiv, Edición 1, 2022, ISSN 2692-8205
Editor: bioRxiv
DOI: 10.1101/2022.05.09.491086