Peptide Killers of Bacteria

Projektinformationen

PeptideKillers

ID Finanzhilfevereinbarung: 101001470

DOI

10.3030/101001470

EK-Unterschriftsdatum 25 Mai 2021

Startdatum 1 Januar 2022

Enddatum 31 Dezember 2026

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 2 315 705,00

EU-Beitrag

€ 2 315 705,00

Koordiniert durch

Masarykova univerzita
Czechia

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Veröffentlichungen

Conference proceedings (1)

HOW LARGE MOLECULES CAN ENTER CELL

Autoren: Sukeník Lukáš; Deb Rahul; Vácha Robert
Veröffentlicht in: Czech Chemical Society Symposium Series - Annual meeting of the National Institute of Virology and Bacteriology (NIVB), Ausgabe 3, 2022, Seite(n) 368
Herausgeber: National Institute of Virology and Bacteriology

Peer reviewed articles (13)

Insertases scramble lipids: Molecular simulations of MTCH2

Autoren: Ladislav Bartoš, Anant K. Menon, Robert Vácha
Veröffentlicht in: Structure, Ausgabe 32, 2024, Seite(n) 505-510.e4, ISSN 0969-2126
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.str.2024.01.012

Pathways to a Shiny Future: Building the Foundation for Computational Physical Chemistry and Biophysics in 2050

Autoren: Denys Biriukov, Robert Vácha
Veröffentlicht in: ACS Physical Chemistry Au, Ausgabe 4, 2024, Seite(n) 302-313, ISSN 2694-2445
Herausgeber: ASC Publications
DOI: 10.1021/acsphyschemau.4c00003

Enhanced diffusion through multivalency

Autoren: Ladislav Bartoš, Mikael Lund, Robert Vácha
Veröffentlicht in: Soft Matter, Ausgabe 21, 2025, Seite(n) 179-185, ISSN 1744-683X
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4sm00778f

Optimizing properties of translocation-enhancing transmembrane proteins

Autoren: Ladislav Bartoš, Martina Drabinová, Robert Vácha
Veröffentlicht in: Biophysical Journal, Ausgabe 123, 2024, Seite(n) 1240-1252, ISSN 0006-3495
Herausgeber: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2024.04.009

Sequence and structural determinants of RNAPII CTD phase-separation and phosphorylation by CDK7

Autoren: Katerina Linhartova, Francesco Luca Falginella, Martin Matl, Marek Sebesta, Robert Vácha, Richard Stefl
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 15, 2024, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-53305-2

Binding of DEP domain to phospholipid membranes: More than just electrostatics

Autoren: Francesco L. Falginella, Marek Kravec, Martina Drabinová, Petra Paclíková, Vítĕzslav Bryja, Robert Vácha
Veröffentlicht in: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes, Ausgabe Volume 1864, Ausgabe 10, 1 October 2022, 2022, Seite(n) 1-12, ISSN 0005-2736
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bbamem.2022.183983

Magainin 2 and PGLa in bacterial membrane mimics IV: Membrane curvature and partitioning

Autoren: Enrico F. Semeraro, Peter Pajtinka, Lisa Marx, Ivo Kabelka, Regina Leber, Karl Lohner, Robert Vácha, Georg Pabst
Veröffentlicht in: BIOPHYSICAL JOURNAL, Ausgabe Volume 121, Ausgabe 23, 6 December 2022, 2022, Seite(n) 4689-4701, ISSN 0006-3495
Herausgeber: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2022.10.018

Amphipathic Helices Can Sense Both Positive and Negative Curvatures of Lipid Membranes

Autoren: Peter Pajtinka, Robert Vácha
Veröffentlicht in: The Journal of Physical Chemistry Letters, Ausgabe 15, 2024, Seite(n) 175-179, ISSN 1948-7185
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.3c02785

Phospholipids are imported into mitochondria by VDAC, a dimeric beta barrel scramblase

Autoren: Helene Jahn, Ladislav Bartoš, Grace I. Dearden, Jeremy S. Dittman, Joost C. M. Holthuis, Robert Vácha, Anant K. Menon
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 14, 2023, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43570-y

Membrane Adsorption Enhances Translocation of Antimicrobial Peptide Buforin 2

Autoren: Mehrnoosh Khodam Hazrati, Robert Vácha
Veröffentlicht in: The Journal of Physical Chemistry B, Ausgabe 128, 2024, Seite(n) 8469-8476, ISSN 1520-6106
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.4c04338

Computational Design of Pore-Forming Peptides with Potent Antimicrobial and Anticancer Activities

Autoren: Rahul Deb, Marcelo D. T. Torres, Miroslav Boudný, Markéta Koběrská, Floriana Cappiello, Miroslav Popper, Kateřina Dvořáková Bendová, Martina Drabinová, Adelheid Hanáčková, Katy Jeannot, Miloš Petřík, Maria Luisa Mangoni, Gabriela Balíková Novotná, Marek Mráz, Cesar de la Fuente-Nunez, Robert Vácha
Veröffentlicht in: Journal of Medicinal Chemistry, Ausgabe 67, 2024, Seite(n) 14040-14061, ISSN 0022-2623
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jmedchem.4c00912

Nanoparticle induced fusion of lipid membranes

Autoren: Sofía Blasco, Lukáš Sukeník, Robert Vácha
Veröffentlicht in: Nanoscale, Ausgabe 16, 2024, Seite(n) 10221-10229, ISSN 2040-3364
Herausgeber: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4nr00591k

Peptide translocation across asymmetric phospholipid membranes

Autoren: Ladislav Bartoš, Robert Vácha
Veröffentlicht in: Biophysical Journal, Ausgabe 123, 2024, Seite(n) 693-702, ISSN 0006-3495
Herausgeber: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2024.02.006

Non-peer reviewed articles (1)

Design guidelines for α-helical peptides that self-assemble into transmembrane barrel pores killing antibiotic-resistant bacteria

Autoren: Rahul Deb; Ivo Kabelka; Jan Přibyl; Edo Vreeker; Giovanni Maglia; Robert Vácha
Veröffentlicht in: bioRxiv, Ausgabe 1, 2022, ISSN 2692-8205
Herausgeber: bioRxiv
DOI: 10.1101/2022.05.09.491086