Peptide Killers of Bacteria

Informations projet

PeptideKillers

N° de convention de subvention: 101001470

DOI

10.3030/101001470

Date de signature de la CE 25 Mai 2021

Date de début 1 Janvier 2022

Date de fin 31 Decembre 2026

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 315 705,00

Contribution de l’UE

€ 2 315 705,00

Coordonné par

Masarykova univerzita
Czechia

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Publications

Conference proceedings (1)

HOW LARGE MOLECULES CAN ENTER CELL

Auteurs: Sukeník Lukáš; Deb Rahul; Vácha Robert
Publié dans: Czech Chemical Society Symposium Series - Annual meeting of the National Institute of Virology and Bacteriology (NIVB), Numéro 3, 2022, Page(s) 368
Éditeur: National Institute of Virology and Bacteriology

Peer reviewed articles (13)

Insertases scramble lipids: Molecular simulations of MTCH2

Auteurs: Ladislav Bartoš, Anant K. Menon, Robert Vácha
Publié dans: Structure, Numéro 32, 2024, Page(s) 505-510.e4, ISSN 0969-2126
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.str.2024.01.012

Pathways to a Shiny Future: Building the Foundation for Computational Physical Chemistry and Biophysics in 2050

Auteurs: Denys Biriukov, Robert Vácha
Publié dans: ACS Physical Chemistry Au, Numéro 4, 2024, Page(s) 302-313, ISSN 2694-2445
Éditeur: ASC Publications
DOI: 10.1021/acsphyschemau.4c00003

Enhanced diffusion through multivalency

Auteurs: Ladislav Bartoš, Mikael Lund, Robert Vácha
Publié dans: Soft Matter, Numéro 21, 2025, Page(s) 179-185, ISSN 1744-683X
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4sm00778f

Optimizing properties of translocation-enhancing transmembrane proteins

Auteurs: Ladislav Bartoš, Martina Drabinová, Robert Vácha
Publié dans: Biophysical Journal, Numéro 123, 2024, Page(s) 1240-1252, ISSN 0006-3495
Éditeur: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2024.04.009

Sequence and structural determinants of RNAPII CTD phase-separation and phosphorylation by CDK7

Auteurs: Katerina Linhartova, Francesco Luca Falginella, Martin Matl, Marek Sebesta, Robert Vácha, Richard Stefl
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-53305-2

Binding of DEP domain to phospholipid membranes: More than just electrostatics

Auteurs: Francesco L. Falginella, Marek Kravec, Martina Drabinová, Petra Paclíková, Vítĕzslav Bryja, Robert Vácha
Publié dans: Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes, Numéro Volume 1864, Numéro 10, 1 October 2022, 2022, Page(s) 1-12, ISSN 0005-2736
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.bbamem.2022.183983

Magainin 2 and PGLa in bacterial membrane mimics IV: Membrane curvature and partitioning

Auteurs: Enrico F. Semeraro, Peter Pajtinka, Lisa Marx, Ivo Kabelka, Regina Leber, Karl Lohner, Robert Vácha, Georg Pabst
Publié dans: BIOPHYSICAL JOURNAL, Numéro Volume 121, Numéro 23, 6 December 2022, 2022, Page(s) 4689-4701, ISSN 0006-3495
Éditeur: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2022.10.018

Amphipathic Helices Can Sense Both Positive and Negative Curvatures of Lipid Membranes

Auteurs: Peter Pajtinka, Robert Vácha
Publié dans: The Journal of Physical Chemistry Letters, Numéro 15, 2024, Page(s) 175-179, ISSN 1948-7185
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.3c02785

Phospholipids are imported into mitochondria by VDAC, a dimeric beta barrel scramblase

Auteurs: Helene Jahn, Ladislav Bartoš, Grace I. Dearden, Jeremy S. Dittman, Joost C. M. Holthuis, Robert Vácha, Anant K. Menon
Publié dans: Nature Communications, Numéro 14, 2023, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-43570-y

Membrane Adsorption Enhances Translocation of Antimicrobial Peptide Buforin 2

Auteurs: Mehrnoosh Khodam Hazrati, Robert Vácha
Publié dans: The Journal of Physical Chemistry B, Numéro 128, 2024, Page(s) 8469-8476, ISSN 1520-6106
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.4c04338

Computational Design of Pore-Forming Peptides with Potent Antimicrobial and Anticancer Activities

Auteurs: Rahul Deb, Marcelo D. T. Torres, Miroslav Boudný, Markéta Koběrská, Floriana Cappiello, Miroslav Popper, Kateřina Dvořáková Bendová, Martina Drabinová, Adelheid Hanáčková, Katy Jeannot, Miloš Petřík, Maria Luisa Mangoni, Gabriela Balíková Novotná, Marek Mráz, Cesar de la Fuente-Nunez, Robert Vácha
Publié dans: Journal of Medicinal Chemistry, Numéro 67, 2024, Page(s) 14040-14061, ISSN 0022-2623
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jmedchem.4c00912

Nanoparticle induced fusion of lipid membranes

Auteurs: Sofía Blasco, Lukáš Sukeník, Robert Vácha
Publié dans: Nanoscale, Numéro 16, 2024, Page(s) 10221-10229, ISSN 2040-3364
Éditeur: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4nr00591k

Peptide translocation across asymmetric phospholipid membranes

Auteurs: Ladislav Bartoš, Robert Vácha
Publié dans: Biophysical Journal, Numéro 123, 2024, Page(s) 693-702, ISSN 0006-3495
Éditeur: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2024.02.006

Non-peer reviewed articles (1)

Design guidelines for α-helical peptides that self-assemble into transmembrane barrel pores killing antibiotic-resistant bacteria

Auteurs: Rahul Deb; Ivo Kabelka; Jan Přibyl; Edo Vreeker; Giovanni Maglia; Robert Vácha
Publié dans: bioRxiv, Numéro 1, 2022, ISSN 2692-8205
Éditeur: bioRxiv
DOI: 10.1101/2022.05.09.491086