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Neural Spectral Image Decoding

Leistungen

Veröffentlichungen

Efficient Photoacoustic Image Synthesis with Deep Learning

Autoren: Tom Rix; Kris K. Dreher; Jan-Hinrich Nölke; Melanie Schellenberg; Minu D. Tizabi; Alexander Seitel; Lena Maier-Hein
Veröffentlicht in: Sensors, Ausgabe 23 (16), 2023, Seite(n) 7085 ff, ISSN 1424-8220
Herausgeber: Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI)
DOI: 10.3390/s23167085

Semantic segmentation of multispectral photoacoustic images using deep learning

Autoren: Melanie Schellenberg, Kris K. Dreher, Niklas Holzwarth, Fabian Isensee, Annika Reinke, Nicholas Schreck, Alexander Seitel, Minu D. Tizabi, Lena Maier-Hein, and Janek Gröhl
Veröffentlicht in: Photoacoustics, 2022, ISSN 2213-5979
Herausgeber: Elsevier GmbH
DOI: 10.1016/j.pacs.2022.100341

Photoacoustic image synthesis with generative adversarial networks

Autoren: Melanie Schellenberg, Janek Gröhl, Kris K. Dreher, Jan-Hinrich Nölke, Niklas Holzwarth, Minu D. Tizabi, Alexander Seitel, Lena Maier-Hein,
Veröffentlicht in: Photoacoustics, 2022, ISSN 2213-5979
Herausgeber: Elsevier GmbH
DOI: 10.1016/j.pacs.2022.100402

Spectral imaging enables contrast agent-free real-time ischemia monitoring in laparoscopic surgery

Autoren: Leonardo Ayala; Tim J. Adler; Silvia Seidlitz; Sebastian Wirkert; Christina Engels; Alexander Seitel; Jan Sellner; Alexey Aksenov; Matthias Bodenbach; Pia Bader; Sebastian Baron; Anant Vemuri; Manuel Wiesenfarth; Nicholas Schreck; Diana Mindroc; Minu Tizabi; Sebastian Pirmann; Brittaney Everitt; Annette Kopp-Schneider; Dogu Teber; Lena Maier-Hein
Veröffentlicht in: Science Advances, Ausgabe 10(9), 2023, ISSN 2375-2548
Herausgeber: American Association for the Advancement of Science (AAAS)
DOI: 10.1101/2022.03.08.22271465

SIMPA: an open-source toolkit for simulation and image processing for photonics and acoustics

Autoren: Janek Gröhl; Kris K. Dreher; Melanie Schellenberg; Tom Rix; Niklas Holzwarth; Patricia Vieten; Leonardo Ayala; Sarah E. Bohndiek; Alexander Seitel; Lena Maier-Hein
Veröffentlicht in: Journal of Biomedical Optics, Ausgabe 8, 2022, ISSN 1083-3668
Herausgeber: S P I E - International Society for Optical Engineering
DOI: 10.1117/1.jbo.27.8.083010

ICG-augmented hyperspectral imaging for visualization of intestinal perfusion compared to conventional ICG fluorescence imaging: An experimental study.

Autoren: Studier-Fischer, A., Schwab, F. M., Rees, M., Seidlitz, S., Sellner, J., Özdemir, B., Ayala, L., Odenthal, J., Knoedler, S., Kowalewski, K.-F., Haney, C. M., Dietrich, M., Salg, G. A., Kenngott, H. G., Müller-Stich, B. P., Maier-Hein, L., & Nickel, F.
Veröffentlicht in: International Journal of Surgery, Ausgabe 109(12), 2023, ISSN 1743-9191
Herausgeber: Surgical Association
DOI: 10.1097/js9.0000000000000706

HeiPorSPECTRAL - the Heidelberg Porcine HyperSPECTRAL Imaging Dataset of 20 Physiological Organs

Autoren: Alexander Studier-Fischer, Silvia Seidlitz, Jan Sellner, Marc Bressan, Berkin Özdemir, Leonardo Ayala, Jan Odenthal, Samuel Knoedler, Karl-Friedrich Kowalewski, Caelan Max Haney, Gabriel Salg, Maximilian Dietrich, Hannes Kenngott, Ines Gockel, Thilo Hackert, Beat Peter Müller-Stich, Lena Maier-Hein & Felix Nickel
Veröffentlicht in: Scientific Data, Ausgabe 10(414), 2023, ISSN 2052-4463
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41597-023-02315-8

Application-driven Validation of Posteriors in Inverse Problems

Autoren: Tim J. Adler, Jan-Hinrich Nölke, Annika Reinke, Minu Dietlinde Tizabi, Sebastian Gruber, Dasha Trofimova, Lynton Ardizzone, Paul F. Jaeger, Florian Buettner, Ullrich Köthe, Lena Maier-Hein
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: arXiv
DOI: 10.48550/arxiv.2309.09764

Understanding metric-related pitfalls in image analysis validation

Autoren: Annika Reinke, Minu D. Tizabi, Michael Baumgartner, Matthias Eisenmann, Doreen Heckmann-Nötzel, A. Emre Kavur, Tim Rädsch, Carole H. Sudre, Laura Acion, Michela Antonelli, Tal Arbel, Spyridon Bakas, Arriel Benis, Matthew Blaschko, Florian Buettner, M. Jorge Cardoso, Veronika Cheplygina, Jianxu Chen, Evangelia Christodoulou, Beth A. Cimini, Gary S. Collins, Keyvan Farahani, Luciana Ferrer, Adrian
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: arXiv
DOI: 10.48550/arxiv.2302.01790

Metrics reloaded: Recommendation for image analysis validation

Autoren: Lena Maier-Hein, Annika Reinke, Patrick Godau, Minu D. Tizabi, Florian Buettner, Evangelia Christodoulou, Ben Glocker, Fabian Isensee, Jens Kleesiek, Michal Kozubek, Mauricio Reyes, Michael A. Riegler, Manuel Wiesenfarth, A. Emre Kavur, Carole H. Sudre, Michael Baumgartner, Matthias Eisenmann, Doreen Heckmann-Nötzel, A. Tim Rädsch, Laura Acion, Michela Antonelli, Tal Arbel, Spyridon Bakas, Arrie
Veröffentlicht in: 2023
Herausgeber: arXiv
DOI: 10.48550/arxiv.2206.01653

Machine learning-based analysis of hyperspectral images for automated sepsis diagnosis

Autoren: Dietrich, Maximilian; Seidlitz, Silvia; Schreck, Nicholas; Wiesenfarth, Manuel; Godau, Patrick; Tizabi, Minu; Sellner, Jan; Marx, Sebastian; Kn��dler, Samuel; Allers, Michael M.; Ayala, Leonardo; Schmidt, Karsten; Brenner, Thorsten; Studier-Fischer, Alexander; Nickel, Felix; M��ller-Stich, Beat P.; Kopp-Schneider, Annette; Weigand, Markus A.; Maier-Hein, Lena
Veröffentlicht in: arXiv, 2021
Herausgeber: arXiv
DOI: 10.48550/arxiv.2106.08445

Unsupervised Domain Transfer with Conditional Invertible Neural Networks

Autoren: Kris K. Dreher, Leonardo Ayala, Melanie Schellenberg, Marco Hübner, Jan-Hinrich Nölke, Tim J. Adler, Silvia Seidlitz, Jan Sellner, Alexander Studier-Fischer, Janek Gröhl, Felix Nickel, Ullrich Köthe, Alexander Seitel, Lena Maier-Hein
Veröffentlicht in: Lecture Notes in Computer Science, Ausgabe 14220, 2023, ISBN 978-3-031-43907-0
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1007/978-3-031-43907-0_73

Semantic segmentation of surgical hyperspectral images under geometric domain shifts

Autoren: Sellner, Jan; Seidlitz, Silvia; Studier-Fischer, Alexander; Motta, Alessandro; Özdemir, Berkin; Müller-Stich, Beat Peter; Nickel, Felix; Maier-Hein, Lena
Veröffentlicht in: Lecture Notes in Computer Science, Ausgabe 14228, 2023, ISBN 978-3-031-43996-4
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1007/978-3-031-43996-4_59

Spectral Organ Fingerprints For Machine Learning-Based Intraoperative Tissue Classification With Hyperspectral Imaging

Autoren: Alexander Studier-Fischer, Silvia Seidlitz, Jan Sellner, Berkin Özdemir, Manuel Wiesenfarth, Leonardo Ayala, Jan Odenthal, Samuel Knödler, Karl-Friedrich Kowalewski, Caelan Max Haney, Isabella Camplisson, Maximilian Dietrich, Karsten Schmidt, Gabriel Alexander Salg, Hannes Götz Kenngott, Tim Julian Adler, Nicholas Schreck, Annette Kopp-Schneider, Klaus Maier-Hein, Lena Maier-Hein, Beat Peter M
Veröffentlicht in: Scientific Reports, Ausgabe 12, 2022, ISSN 2045-2322
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41598-022-15040-w

Robust deep learning-based semantic organ segmentation in hyperspectral images

Autoren: Silvia Seidlitz, Jan Sellner, Jan Odenthal, Berkin Özdemir, Alexander Studier-Fischer, Samuel Knödler, Leonardo Ayala, Tim Adler, Hannes G Kenngott, Minu Tizabi, Martin Wagner, Felix Nickel, Beat P Müller-Stich, Lena Maier-Hein
Veröffentlicht in: Medical Image Analysis, Ausgabe 80, 2022, ISSN 1361-8415
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.media.2022.102488

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