Description du projet
Comprendre l’impact des duplications du génome entier sur l’adaptation
La duplication du génome entier (DGE) est probablement la mutation la plus grave qu’un organisme puisse subir. Les DGE sont souvent fatales, mais les polyploïdes qui en résultent et qui survivent au choc initial subi par les processus cellulaires semblent pouvoir prospérer. La question de savoir si les conditions créées par les DGE sont bénéfiques ou préjudiciables à l’adaptation est une question de longue date en biologie évolutive. Le projet POLYGARCH, financé par l’UE, combinera une modélisation évolutive de pointe, de nouveaux outils d’apprentissage automatique et des données génomiques multi-espèces issues de séquençage à court et long termes pour déterminer comment les DGE modifient l’architecture génétique et génomique de l’adaptation locale. Les résultats obtenus amélioreront la compréhension scientifique du succès évolutif des polyploïdes, apporteront de nouvelles informations sur les facteurs qui influencent la distribution actuelle des populations et des espèces polyploïdes, et aideront à prédire la réponse des polyploïdes aux changements environnementaux.
Objectif
Whole-genome duplication (WGD) is arguably the most severe mutation that an organism may undergo. As such, WGDs are often fatal, but the resulting polyploids that survive the initial shock to cellular processes may ultimately thrive. Whether conditions created by WGDs are beneficial or detrimental to adaptation is a long-standing question in evolutionary biology, with important implications for domestication and crop breeding. A key determinant of evolutionary responses is the genetic and genomic architecture of adaptive traits: i.e. the control of phenotypes by one or many loci, the interactions between alleles, positions of loci in relation to genomic features, and structural arrangements. By combining cutting-edge evolutionary modelling, novel machine-learning tools, and multi-species genomic data from short- and long-read sequencing, I propose to determine how WGDs alter the genetic and genomic architecture of local adaptation. Such knowledge will advance our understanding of the evolutionary success of polyploids, provide insights into factors influencing the current distribution of polypoid populations and species, as well as yield important information for predicting how polyploids respond to environmental change.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences naturellessciences biologiquesbiologie de l'évolution
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Programme(s)
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2020
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MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
NG7 2RD Nottingham
Royaume-Uni