Descrizione del progetto
Ripercussioni della poliploidia sull’adattamento
La poliploidia è probabilmente la mutazione più grave che un organismo può subire: spesso, infatti, è fatale, ma i poliploidi risultanti che sopravvivono allo shock iniziale dei processi cellulari hanno la possibilità, alla fine, di prosperare. Se le condizioni create dalla poliploidia siano benefiche o dannose per l’adattamento è una domanda che la biologia evoluzionistica si pone da molto tempo. Il progetto POLYGARCH, finanziato dall’UE, combinerà una modellazione evolutiva all’avanguardia, strumenti di apprendimento automatico innovativi e dati genomici multispecie da sequenze a lettura breve e lunga per determinare in che modo la poliploidia altera l’architettura genetica e genomica dell’adattamento locale. I risultati miglioreranno la comprensione scientifica del successo evolutivo dei poliploidi, forniranno informazioni sui fattori che influenzano l’attuale distribuzione delle popolazioni e delle specie poliploidi e contribuiranno a prevedere il modo in cui i poliploidi rispondono ai cambiamenti ambientali.
Obiettivo
Whole-genome duplication (WGD) is arguably the most severe mutation that an organism may undergo. As such, WGDs are often fatal, but the resulting polyploids that survive the initial shock to cellular processes may ultimately thrive. Whether conditions created by WGDs are beneficial or detrimental to adaptation is a long-standing question in evolutionary biology, with important implications for domestication and crop breeding. A key determinant of evolutionary responses is the genetic and genomic architecture of adaptive traits: i.e. the control of phenotypes by one or many loci, the interactions between alleles, positions of loci in relation to genomic features, and structural arrangements. By combining cutting-edge evolutionary modelling, novel machine-learning tools, and multi-species genomic data from short- and long-read sequencing, I propose to determine how WGDs alter the genetic and genomic architecture of local adaptation. Such knowledge will advance our understanding of the evolutionary success of polyploids, provide insights into factors influencing the current distribution of polypoid populations and species, as well as yield important information for predicting how polyploids respond to environmental change.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- scienze naturaliscienze biologichebiologia evoluzionistica
- scienze naturaliscienze biologichegeneticamutazione
- scienze agricoleagricoltura, silvicoltura e pescaagricolturaagronomiamiglioramento delle piante
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(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2020
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MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinatore
NG7 2RD Nottingham
Regno Unito