Skip to main content
Przejdź do strony domowej Komisji Europejskiej (odnośnik otworzy się w nowym oknie)
polski pl
CORDIS - Wyniki badań wspieranych przez UE
CORDIS

Impact of whole-genome duplications on the genetic and genomic architecture of adaptation

Opis projektu

Wpływ duplikacji całego genomu na adaptację

Duplikacja całego genomu stanowi jedną z najpoważniejszych mutacji, jakiej może ulec organizm, często prowadzącą do śmierci. Powstające w ten sposób poliploidy mogą jednak przetrwać i żyć, jeśli wytrzymają początkowe zakłócenie procesów komórkowych. To, czy warunki stwarzane przez tę mutację są korzystne lub niekorzystne dla adaptacji, stanowi przedmiot ważnej debaty na polu biologii ewolucyjnej. Zespół finansowanego ze środków Unii Europejskiej projektu POLYGARCH zamierza połączyć najnowocześniejsze metody modelowania ewolucyjnego, nowatorskie algorytmy uczenia maszynowego i dane genomiczne dotyczące wielu gatunków, pozyskane dzięki metodom sekwencjonowania opartym na długich i krótkich odczytach DNA, aby ustalić, w jaki sposób duplikacja całego genomu wpływa na architektury genetyczne i genomiczne związane z lokalną adaptacją. Rezultaty badań przyczynią się do lepszego zrozumienia sukcesu ewolucyjnego poliploidów, dostarczą nowej wiedzy na temat czynników wpływających na obecne rozmieszczenie populacji i gatunków poliploidalnych, a także pozwolą przewidywać reakcję poliploidów na zmiany środowiskowe.

Cel

Whole-genome duplication (WGD) is arguably the most severe mutation that an organism may undergo. As such, WGDs are often fatal, but the resulting polyploids that survive the initial shock to cellular processes may ultimately thrive. Whether conditions created by WGDs are beneficial or detrimental to adaptation is a long-standing question in evolutionary biology, with important implications for domestication and crop breeding. A key determinant of evolutionary responses is the genetic and genomic architecture of adaptive traits: i.e. the control of phenotypes by one or many loci, the interactions between alleles, positions of loci in relation to genomic features, and structural arrangements. By combining cutting-edge evolutionary modelling, novel machine-learning tools, and multi-species genomic data from short- and long-read sequencing, I propose to determine how WGDs alter the genetic and genomic architecture of local adaptation. Such knowledge will advance our understanding of the evolutionary success of polyploids, provide insights into factors influencing the current distribution of polypoid populations and species, as well as yield important information for predicting how polyploids respond to environmental change.

Dziedzina nauki (EuroSciVoc)

Słowa kluczowe

Program(-y)

Temat(-y)

System finansowania

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania

Zaproszenie do składania wniosków

(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2020

Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszenia

Koordynator

THE UNIVERSITY OF NOTTINGHAM
Wkład UE netto
€ 212 933,76
Adres
University Park
NG7 2RD Nottingham
Zjednoczone Królestwo
Region
East Midlands (England) Derbyshire and Nottinghamshire Nottingham
Rodzaj działalności
Higher or Secondary Education Establishments
Linki
Koszt całkowity
€ 212 933,76