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A Riboescaper study: Protein synthesis driven by deficiently assembled ribosomes

Description du projet

Conséquences fonctionnelles de la biogenèse défectueuse des ribosomes

La biogenèse des ribosomes est un processus complexe étroitement coordonné avec la demande de ribosomes pour assurer la croissance cellulaire. Les ribosomes sont générés lors d’étapes clés où l’ARN ribosomique est assemblé avec les protéines ribosomiques. Récemment, le lien entre la biogenèse défectueuse des ribosomes et les maladies humaines est devenu évident. Les mutations des protéines ribosomiques, ou facteurs de biogenèse, augmentent les probabilités de développement du cancer. Lorsqu’une sous‑unité préribosomique subit une erreur d’assemblage, la particule est retenue dans le noyau. Certaines préparticules aberrantes échappent aux mécanismes de surveillance et sont exportées vers le cytoplasme. Le projet RiboEscapers, financé par l’UE, vise à appliquer un profilage de pointe des ribosomes pour étudier les conséquences fonctionnelles des mutations des protéines ribosomiques, qui génèrent des ribosomes défectueux exportés vers le cytoplasme («RiboEscapers») et participent activement à la traduction.

Objectif

Ribosomes are RNA-protein complexes found in all living cells. Ribosome biogenesis is a complex, cellular process that is tightly coordinated with ribosomes demand to ensure optimal cellular adaptation, growth and proliferation. In eukaryotes, ribosomes are sequentially generated in key steps where the ribosomal RNA (rRNA) is folded, modified, processed, and assembled with ribosomal proteins (r-proteins) to form the two ribosomal subunits. Recently, the connection of defective ribosome biogenesis with human diseases has become clear. This is the case of the so-called ribosomopathies, human syndromes caused by mutations in genes encoding either r-proteins or ribosome biogenesis factors, which are known to increase the probabilities of cancer development. Considering the multi-steps pathway of ribosome biogenesis, the possibilities to introduce errors with possible harmful effects for cell viability are high. In this context, cells have developed multiple surveillance mechanisms to supervise the structural and functional integrity of the ribosome particle. When a preribosomal subunit suffers an assembly error, in most of the cases, the aberrant particle is retained in the nucleus. However, some aberrant pre-particles have been shown to escape the surveillance mechanisms and to be exported to the cytoplasm.
This proposal, aims to explore the functional consequences of r-protein gene mutations, which generate defective ribosomal particles that are successfully exported to the cytoplasm (RiboEscapers) and actively participate in translation in yeast cell. For this purpose, the research action will combine traditional yeast tools together with state-of-the-art methodologies, such ribosome profiling to provide a detailed overview of the r-protein roles in ribosome biogenesis, as well as the consequences of specific defects in this process.

Coordinateur

UNIVERSIDAD DE SEVILLA
Contribution nette de l'UE
€ 160 932,48
Adresse
CALLE S. FERNANDO 4
41004 Sevilla
Espagne

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Région
Sur Andalucía Sevilla
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total
€ 160 932,48