Projektbeschreibung
Funktionelle Konsequenzen der gestörten Ribosomenbiogenese
Der komplexe Prozess der Ribosomenbiogenese ist eng mit dem Bedarf an Ribosomen für das korrekte Zellwachstum verknüpft. Die Bildung von Ribosomen erfolgt in mehreren wichtigen Schritten, bei denen ribosomale RNA mit ribosomalen Proteinen assembliert. Der Zusammenhang zwischen einer gestörten Ribosomenbiogenese und menschlichen Erkrankungen ist in jüngster Zeit deutlich geworden. Mutationen in ribosomalen Proteinen oder Biogenesefaktoren erhöhen das Risiko für die Entstehung von Krebserkrankungen. Wenn bei einer präribosomalen Untereinheit ein Assemblierungsfehler auftritt, bleibt das fehlerhafte Partikel im Kern zurück. Manche fehlerhaften präribosomalen Partikel umgehen die Überwachungsmechanismen und werden in das Zytoplasma exportiert. Das EU-finanzierte Projekt RiboEscapers möchte anhand von modernen Ribosomen-Profilen die funktionellen Konsequenzen von Mutationen ribosomaler Proteine untersuchen, durch die fehlerhafte Ribosomen entstehen, die an das Zytoplasma exportiert werden (RiboEscapers) und aktiv an der Translation beteiligt sind.
Ziel
Ribosomes are RNA-protein complexes found in all living cells. Ribosome biogenesis is a complex, cellular process that is tightly coordinated with ribosomes demand to ensure optimal cellular adaptation, growth and proliferation. In eukaryotes, ribosomes are sequentially generated in key steps where the ribosomal RNA (rRNA) is folded, modified, processed, and assembled with ribosomal proteins (r-proteins) to form the two ribosomal subunits. Recently, the connection of defective ribosome biogenesis with human diseases has become clear. This is the case of the so-called ribosomopathies, human syndromes caused by mutations in genes encoding either r-proteins or ribosome biogenesis factors, which are known to increase the probabilities of cancer development. Considering the multi-steps pathway of ribosome biogenesis, the possibilities to introduce errors with possible harmful effects for cell viability are high. In this context, cells have developed multiple surveillance mechanisms to supervise the structural and functional integrity of the ribosome particle. When a preribosomal subunit suffers an assembly error, in most of the cases, the aberrant particle is retained in the nucleus. However, some aberrant pre-particles have been shown to escape the surveillance mechanisms and to be exported to the cytoplasm.
This proposal, aims to explore the functional consequences of r-protein gene mutations, which generate defective ribosomal particles that are successfully exported to the cytoplasm (RiboEscapers) and actively participate in translation in yeast cell. For this purpose, the research action will combine traditional yeast tools together with state-of-the-art methodologies, such ribosome profiling to provide a detailed overview of the r-protein roles in ribosome biogenesis, as well as the consequences of specific defects in this process.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht.
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