Description du projet
Facteurs de transcription et traitement de l’ARNm
La combinaison de facteurs de transcription (FT) et de cofacteurs régule le processus de transcription d’une manière spatio-temporelle précise. La classe des FT Hox, conservée au cours de l’évolution, est un exemple de la façon dont un nombre restreint de ces facteurs est capable de piloter divers programmes de transcription. Le projet RNA-NetHOX, financé par l’UE, entend utiliser des systèmes modèles pour étudier l’impact de la régulation du traitement de l’ARNm dépendant des Hox. Cette recherche permettra d’élucider comment les interactions avec les facteurs d’épissage ont un impact sur les fonctions Hox in vivo dans les embryons de drosophile. La coopération entre Hox et facteurs d’épissage sera étudiée plus en détail dans des cribles d’interaction à grande échelle de plusieurs Hox humains et de 2 000 protéines régulatrices de l’ARN dans divers contextes cellulaires normaux et pathologiques.
Objectif
Cell fate decisions is governed by the fine-tuned regulation of gene expression in all living organism. It is mostly realized by the cell-type specific assembly of regulatory networks consisting of Transcription Factors (TFs) and cofactors proteins. Thus, a multitude of combination between TF and cofactors will be set up to regulate the transcription in a precise spatiotemporal manner. The evolutionary conserved class of Hox TFs perfectly illustrates how a restricted number of TFs is able to promote diverse transcriptional programs. Hox proteins are involved in the specification of body forms and organs in animals. Despite this notorious architectural role, their operating mode remains controversial: they recognize similar DNA-binding sites in vitro, in sharp contrast with their specific functions in vivo. Thus, Hox proteins are likely acting with cofactors in vivo, and their identification was the core of my post-doctoral work. Notably, it revealed that mRNA-processing related proteins could constitute an important class of Hox cofactors. Thus, Hox specificity could also rely on mRNA-processing regulation, providing insightful molecular entry points to understand Hox function in development and disease. My research project aims at elucidating this novel facet of Hox activity. I propose two complementary aims developed in two model systems in order to decipher the molecular and functional impact of Hox-dependent mRNA processing regulation. I will decipher how interactions with splicing factors impact on the Hox functions in vivo in Drosophila embryos. Moreover, I will enlarge the cooperative role of HOX and splicing factors by performing large-scale interaction-screens of several human HOX and 2000 RNA-regulatory proteins in various normal and pathological cell contexts. Overall, my research program has the ambition to open novel perspectives on the role of TFs at the mRNA-regulatory level.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
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Programme(s)
Régime de financement
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Coordinateur
75794 Paris
France