Opis projektu
Czynniki transkrypcyjne i przetwarzanie mRNA
Kombinacja czynników i kofaktorów transkrypcyjnych odpowiada za regulację procesu transkrypcji ze ścisłą precyzją przestrzenno-czasową. Ewolucyjnie zachowana klasa czynników transkrypcyjnych Hox (białek homeotycznych) stanowi przykład tego, jak ograniczona liczba tych czynników jest w stanie aktywować zróżnicowane programy transkrypcyjne. Celem finansowanego ze środków UE projektu RNA-NetHOX jest wykorzystanie systemów modelowych, aby zbadać wpływ regulacji procesu przetwarzania mRNA zależnej od genów homeotycznych. Badania te pozwolą określić, w jaki sposób interakcje z procesami splicingu wpływają na funkcje białek homeotycznych w warunkach in vivo na przykładzie zarodków muszki z rodzaju Drosophila. Badacze skupią się na dogłębnej analizie współpracy między czynnikami transkrypcyjnymi Hox i splicingiem w wielkoskalowych badaniach nad wieloma czynnikami transkrypcyjnymi HOX u człowieka oraz 2 000 białek regulacyjnych RNA w różnorodnych przypadkach prawidłowo i nieprawidłowo funkcjonujących komórek.
Cel
Cell fate decisions is governed by the fine-tuned regulation of gene expression in all living organism. It is mostly realized by the cell-type specific assembly of regulatory networks consisting of Transcription Factors (TFs) and cofactors proteins. Thus, a multitude of combination between TF and cofactors will be set up to regulate the transcription in a precise spatiotemporal manner. The evolutionary conserved class of Hox TFs perfectly illustrates how a restricted number of TFs is able to promote diverse transcriptional programs. Hox proteins are involved in the specification of body forms and organs in animals. Despite this notorious architectural role, their operating mode remains controversial: they recognize similar DNA-binding sites in vitro, in sharp contrast with their specific functions in vivo. Thus, Hox proteins are likely acting with cofactors in vivo, and their identification was the core of my post-doctoral work. Notably, it revealed that mRNA-processing related proteins could constitute an important class of Hox cofactors. Thus, Hox specificity could also rely on mRNA-processing regulation, providing insightful molecular entry points to understand Hox function in development and disease. My research project aims at elucidating this novel facet of Hox activity. I propose two complementary aims developed in two model systems in order to decipher the molecular and functional impact of Hox-dependent mRNA processing regulation. I will decipher how interactions with splicing factors impact on the Hox functions in vivo in Drosophila embryos. Moreover, I will enlarge the cooperative role of HOX and splicing factors by performing large-scale interaction-screens of several human HOX and 2000 RNA-regulatory proteins in various normal and pathological cell contexts. Overall, my research program has the ambition to open novel perspectives on the role of TFs at the mRNA-regulatory level.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego.
- nauki przyrodniczenauki biologicznebiochemiabiocząsteczkibiałka
- medycyna i nauki o zdrowiumedycyna klinicznaembriologia
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)Koordynator
75794 Paris
Francja