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Decoding Hox specificity from mRNA processing networks

Descrizione del progetto

Fattori di trascrizione ed elaborazione dell’mRNA

La combinazione di fattori di trascrizione (FT) e cofattori è responsabile della regolazione del processo trascrizionale in un preciso modo spaziotemporale. La classe di FT Hox, che si è conservata a livello evolutivo, rappresenta un esempio di come un numero limitato di fattori di trascrizione guidi diversi programmi trascrizionali. Il progetto RNA-NetHOX, finanziato dall’UE, si prefigge di impiegare sistemi modello per studiare l’impatto esercitato dalla regolazione dell’elaborazione dell’mRNA dipendente dai geni Hox. La ricerca chiarirà il modo in cui le interazioni con fattori di splicing si ripercuotono sulle funzioni dei geni Hox in vivo negli embrioni di drosofila. La cooperazione tra i geni Hox e i fattori di splicing sarà ulteriormente approfondita in screening di interazione su larga scala di diversi geni Hox umani e di 2 000 proteine che regolano l’RNA in vari contesti cellulari normali e patologici.

Obiettivo

Cell fate decisions is governed by the fine-tuned regulation of gene expression in all living organism. It is mostly realized by the cell-type specific assembly of regulatory networks consisting of Transcription Factors (TFs) and cofactors proteins. Thus, a multitude of combination between TF and cofactors will be set up to regulate the transcription in a precise spatiotemporal manner. The evolutionary conserved class of Hox TFs perfectly illustrates how a restricted number of TFs is able to promote diverse transcriptional programs. Hox proteins are involved in the specification of body forms and organs in animals. Despite this notorious architectural role, their operating mode remains controversial: they recognize similar DNA-binding sites in vitro, in sharp contrast with their specific functions in vivo. Thus, Hox proteins are likely acting with cofactors in vivo, and their identification was the core of my post-doctoral work. Notably, it revealed that mRNA-processing related proteins could constitute an important class of Hox cofactors. Thus, Hox specificity could also rely on mRNA-processing regulation, providing insightful molecular entry points to understand Hox function in development and disease. My research project aims at elucidating this novel facet of Hox activity. I propose two complementary aims developed in two model systems in order to decipher the molecular and functional impact of Hox-dependent mRNA processing regulation. I will decipher how interactions with splicing factors impact on the Hox functions in vivo in Drosophila embryos. Moreover, I will enlarge the cooperative role of HOX and splicing factors by performing large-scale interaction-screens of several human HOX and 2000 RNA-regulatory proteins in various normal and pathological cell contexts. Overall, my research program has the ambition to open novel perspectives on the role of TFs at the mRNA-regulatory level.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

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Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2020

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Coordinatore

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Contributo netto dell'UE
€ 116 953,92
Indirizzo
RUE MICHEL ANGE 3
75794 Paris
Francia
Regione
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale
€ 184 707,84