Descrizione del progetto
Esaminare il meccanismo di sorveglianza dell’mRNA
Le cellule eucariote hanno evoluto un meccanismo complesso per regolare il flusso di informazioni dal gene alla proteina. Al livello dell’mRNA esiste un meccanismo di sorveglianza, il percorso di degradazione dell’mRNA mediata da un nonsenso (NMD, Nonsense-Mediated Decay), che rileva e degrada gli mRNA difettosi. Gli scienziati del progetto UPFs_NMD, finanziato dall’UE, propongono un approccio multidisciplinare per studiare l’architettura molecolare e l’interazione tra i diversi componenti dell’NMD. I risultati offriranno approfondimenti importanti sulla struttura e la funzione del meccanismo dell’NMD e contribuiranno a delinearne le implicazioni in diverse malattie, tra cui i disturbi neurologici.
Obiettivo
In eukaryotes, gene expression is highly regulated involving multistep pathways in which mRNA plays a crucial role. Cells have evolved surveillance mechanisms able to detect and degrade defective transcripts. Nonsense-mediated mRNA decay (NMD) is a mRNA surveillance mechanism which detects faulty mRNAs with premature termination codons (PTCs) and targets these transcripts to decay. By modulating the expression of physiological mRNAs, NMD acts as a post-transcriptional regulator controlling important cellular processes in development, stress response, immunity and neuronal differentiation. NMD is of medical importance because mutations or copy number variations of the NMD factors are implicated in human neurological disorders, intellectual disability, schizophrenia, autism, immune diseases and cancer. The mammalian NMD machinery comprises the proteins UPF1, UPF2, and UPF3B, eukaryotic release factors (eRF1 and eRF3a), SMG1 kinase and SMG5-9. Recently UPF3B was found to have a role in translation termination at a premature stop codon, interacting directly with the ribosome, release factors and UPF1, requiring modification of prevalent NMD models. To understand the molecular mechanisms of UPF3B and its role in NMD, this proposal aims to determine the molecular architecture of UPF3B in complex with UPF1, ribosome and mRNA. Furthermore, I will explore the role of the helicase and ubiquitin ligase activities of UPF1 in NMD and protein decay. I will use biochemistry, biophysics, X-ray crystallography and cryo-electron microscopy to identify the UPF3B domains involved in the recognition of NMD substrates and to investigate how UPF3B binding to the UPF1-RNA complex helps trigger mRNA decay.
Such information will shed light on how translation termination and assembly of the NMD machinery are coordinated and therefore will be of key importance for the future development of therapeutic approaches for the future development of therapeutic approaches for NMD- related diseases.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia
- scienze naturali scienze biologiche biofisica
- scienze mediche e della salute medicina clinica psichiatria schizofrenia
- scienze mediche e della salute medicina di base neurologia
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMMA PRINCIPALE
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2020
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
BS8 1QU BRISTOL
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.