Description du projet
Les microARN circulants comme nouveaux biomarqueurs pour le diagnostic du syndrome de Lynch
Les récents développements concernant les méthodes de biopsie liquide et l’analyse des échantillons prélevés ont fait des biomarqueurs sanguins du cancer des outils modernes essentiels pour la prévention et le diagnostic du cancer. Les micro-ARN circulants non codants (c-miR) associés au développement du cancer ont été identifiés et testés dans des applications de dépistage, de diagnostic, de classification des tumeurs, de suivi des traitements et de prédiction des résultats. Pourtant, les c-miR n’ont pas encore été étudiés dans les cohortes liées au syndrome de Lynch. Financé par l’UE, le projet cmiRCan entend utiliser, comme biomarqueurs, les clusters de c-miR présents dans le sérum entier de patients atteints d’un syndrome de Lynch associé à un cancer héréditaire. Ce projet interdisciplinaire combinera recherche clinique, biologie cellulaire et bio-informatique, afin de développer des algorithmes basés sur l’apprentissage automatique pour diagnostiquer et prédire l’apparition de cancers dans la cohorte de patients atteints du syndrome de Lynch.
Objectif
Blood-based cancer biomarkers have become important research targets and together with the recent development of liquid biopsy methods and analysis, they have become interesting future tools for cancer diagnosis. The cell-free small non-coding circulating RNA particles, namely microRNAs (c-miRs) that associate with cancer development, have been identified and tested to be used for cancer screening, diagnosis, tumor subtype classification, chemo- or radio-resistance monitoring, and outcome prognosis. Here we use whole serum c-miR clusters from patients with hereditary cancer syndrome, called Lynch syndrome, as a biomarker and we develop machine learning-based algorithms to diagnose and predict cancer occurrence in this patient cohort. We also functionally test how these c-miR clusters effect lynch syndrome linked to tumor growth.
This interdisciplinary project combines clinical, cell biological and bioinformatic research and it will reciprocally transfer knowledge between research, Tiina Jokela and host institute, University of Jyväskylä and secondment institutes; University of Helsinki and Helsinki University Hospital. The proposed project support researcher Tiina Jokela to also gain transferable independent research skills and support her future career goal to become the leader of her own academic research group in the cancer research field.
Champ scientifique
Programme(s)
Régime de financement
MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panelCoordinateur
40100 Jyvaskyla
Finlande