Descrizione del progetto
MicroRNA circolanti come nuovi biomarcatori nella diagnosi della sindrome di Lynch
I recenti sviluppi nei metodi e nelle analisi della biopsia liquida hanno trasformato i biomarcatori tumorali circolanti nel sangue in strumenti moderni e fondamentali per la prevenzione e la diagnosi del cancro. Le particelle di microRNA circolanti (c-miR) non codificanti prive di cellule associate allo sviluppo del cancro sono state identificate e testate in applicazioni per lo screening del cancro, la diagnosi, la classificazione tumorale, il monitoraggio del trattamento e la previsione dell’esito. Tuttavia, i c-miR non sono stati fino ad oggi studiati in coorti di sindrome di Lynch. Il progetto cmiRCan, finanziato dall’UE, si propone di utilizzare come biomarcatore cluster interi di c-miR sierici provenienti da pazienti con sindrome di Lynch ereditaria associata a cancro. Il progetto interdisciplinare combinerà la ricerca clinica, biologica cellulare e bioinformatica per sviluppare algoritmi basati sull’apprendimento automatico allo scopo di diagnosticare e prevedere l’insorgenza del cancro nella coorte di pazienti con sindrome di Lynch.
Obiettivo
Blood-based cancer biomarkers have become important research targets and together with the recent development of liquid biopsy methods and analysis, they have become interesting future tools for cancer diagnosis. The cell-free small non-coding circulating RNA particles, namely microRNAs (c-miRs) that associate with cancer development, have been identified and tested to be used for cancer screening, diagnosis, tumor subtype classification, chemo- or radio-resistance monitoring, and outcome prognosis. Here we use whole serum c-miR clusters from patients with hereditary cancer syndrome, called Lynch syndrome, as a biomarker and we develop machine learning-based algorithms to diagnose and predict cancer occurrence in this patient cohort. We also functionally test how these c-miR clusters effect lynch syndrome linked to tumor growth.
This interdisciplinary project combines clinical, cell biological and bioinformatic research and it will reciprocally transfer knowledge between research, Tiina Jokela and host institute, University of Jyväskylä and secondment institutes; University of Helsinki and Helsinki University Hospital. The proposed project support researcher Tiina Jokela to also gain transferable independent research skills and support her future career goal to become the leader of her own academic research group in the cancer research field.
Campo scientifico
Programma(i)
Argomento(i)
Meccanismo di finanziamento
MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panelCoordinatore
40100 Jyvaskyla
Finlandia