Projektbeschreibung
Zirkulierende microRNAs als neue Biomarker für die Diagnose des Lynch-Syndroms
Die jüngsten Entwicklungen im Bereich der Flüssigbiopsie-Methoden und -Analysen haben Biomarker aus dem Blut zu wichtigen modernen Instrumenten für die Krebsprävention und -diagnose gemacht. Die zellfreien, nicht kodierenden, im Blut zirkulierenden microRNA-Partikel (c-miR), die mit der Krebsentwicklung in Verbindung gebracht werden, wurden identifiziert und in Anwendungen für die Krebsvorsorge, die Diagnose, die Tumorklassifizierung, die Behandlungsüberwachung sowie die Vorhersage der Behandlungsergebnisse getestet. Bislang wurden zellfreie, nicht kodierende, im Blut zirkulierende microRNA-Partikel jedoch nicht in Lynch-Syndrom-Kohorten untersucht. Das EU-finanzierte Projekt cmiRCan zielt darauf ab, Cluster dieser microRNA-Partikel aus dem Gesamtserum von Betroffenen mit erblichem, krebsassoziiertem Lynch-Syndrom als Biomarker zu verwenden. Das interdisziplinäre Projekt wird klinische, zellbiologische und bioinformatische Forschung vereinen, um auf maschinellem Lernen basierende Algorithmen zur Diagnose und Vorhersage des Auftretens von Krebs in der Lynch-Syndrom-Patientenkohorte zu entwickeln.
Ziel
Blood-based cancer biomarkers have become important research targets and together with the recent development of liquid biopsy methods and analysis, they have become interesting future tools for cancer diagnosis. The cell-free small non-coding circulating RNA particles, namely microRNAs (c-miRs) that associate with cancer development, have been identified and tested to be used for cancer screening, diagnosis, tumor subtype classification, chemo- or radio-resistance monitoring, and outcome prognosis. Here we use whole serum c-miR clusters from patients with hereditary cancer syndrome, called Lynch syndrome, as a biomarker and we develop machine learning-based algorithms to diagnose and predict cancer occurrence in this patient cohort. We also functionally test how these c-miR clusters effect lynch syndrome linked to tumor growth.
This interdisciplinary project combines clinical, cell biological and bioinformatic research and it will reciprocally transfer knowledge between research, Tiina Jokela and host institute, University of Jyväskylä and secondment institutes; University of Helsinki and Helsinki University Hospital. The proposed project support researcher Tiina Jokela to also gain transferable independent research skills and support her future career goal to become the leader of her own academic research group in the cancer research field.
Wissenschaftliches Gebiet
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MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panelKoordinator
40100 Jyvaskyla
Finnland