Opis projektu
Krążące mikroRNA jako nowe biomarkery w diagnostyce zespołu Lyncha
Dzięki postępowi w zakresie metod i analizy płynnej biopsji biomarkery raka oznaczane z krwi stały się nowoczesnym narzędziem niezbędnym do diagnozowania chorób nowotworowych i zapobiegania im. Krążące, pozakomórkowe, niekodujące cząsteczki mikroRNA (c-miR) uczestniczące w rozwoju raka poddano identyfikacji i badaniom pod kątem ich zastosowania w badaniach przesiewowych w kierunku raka, diagnozie i klasyfikacji guzów, monitorowaniu leczenia i przewidywaniu jego rezultatów. Do tej pory nie badano jednak c-miR u pacjentów z zespołem Lyncha. Badacze z finansowanego ze środków UE projektu cmiRCan chcą wykorzystać w roli biomarkera agregaty c-miR z surowicy pełnej pobranej od pacjentów z zespołem Lyncha – jednym z zespołów dziedzicznej predyspozycji do nowotworów. Połączą oni badania kliniczne z biologią komórek i metodami bioinformatycznymi w celu opracowania algorytmów opartych na uczeniu maszynowym przeznaczonych do diagnozowania i przewidywania wystąpienia raka u pacjentów z zespołem Lyncha.
Cel
Blood-based cancer biomarkers have become important research targets and together with the recent development of liquid biopsy methods and analysis, they have become interesting future tools for cancer diagnosis. The cell-free small non-coding circulating RNA particles, namely microRNAs (c-miRs) that associate with cancer development, have been identified and tested to be used for cancer screening, diagnosis, tumor subtype classification, chemo- or radio-resistance monitoring, and outcome prognosis. Here we use whole serum c-miR clusters from patients with hereditary cancer syndrome, called Lynch syndrome, as a biomarker and we develop machine learning-based algorithms to diagnose and predict cancer occurrence in this patient cohort. We also functionally test how these c-miR clusters effect lynch syndrome linked to tumor growth.
This interdisciplinary project combines clinical, cell biological and bioinformatic research and it will reciprocally transfer knowledge between research, Tiina Jokela and host institute, University of Jyväskylä and secondment institutes; University of Helsinki and Helsinki University Hospital. The proposed project support researcher Tiina Jokela to also gain transferable independent research skills and support her future career goal to become the leader of her own academic research group in the cancer research field.
Program(-y)
Temat(-y)
System finansowania
MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panelKoordynator
40100 Jyvaskyla
Finlandia