Descripción del proyecto
MicroARN circulantes como nuevos biomarcadores en el diagnóstico del síndrome de Lynch
Los avances recientes en el análisis y los métodos de biopsia líquida han transformado los biomarcadores sanguíneos del cáncer en herramientas modernas esenciales para la prevención y el diagnóstico del cáncer. Las partículas de microARN circulante (c-miR, por sus siglas en inglés) no codificante y libre asociadas al desarrollo del cáncer han sido identificadas y probadas en aplicaciones para la detección del cáncer, su diagnóstico, la clasificación del tumor, el seguimiento terapéutico y la predicción de los resultados. Sin embargo, los c-miR todavía no se han investigado en cohortes afectadas por el síndrome de Lynch. El proyecto cmiRCan, financiado con fondos europeos, tiene como objetivo utilizar grupos de c-miR en suero procedentes de pacientes con síndrome de Lynch hereditario asociado al cáncer como biomarcador. Este proyecto interdisciplinario combinará investigaciones bioinformáticas, clínicas y de biología celular para desarrollar algoritmos basados en el aprendizaje automático a fin de diagnosticar y predecir la aparición del cáncer en la cohorte de pacientes con síndrome de Lynch.
Objetivo
Blood-based cancer biomarkers have become important research targets and together with the recent development of liquid biopsy methods and analysis, they have become interesting future tools for cancer diagnosis. The cell-free small non-coding circulating RNA particles, namely microRNAs (c-miRs) that associate with cancer development, have been identified and tested to be used for cancer screening, diagnosis, tumor subtype classification, chemo- or radio-resistance monitoring, and outcome prognosis. Here we use whole serum c-miR clusters from patients with hereditary cancer syndrome, called Lynch syndrome, as a biomarker and we develop machine learning-based algorithms to diagnose and predict cancer occurrence in this patient cohort. We also functionally test how these c-miR clusters effect lynch syndrome linked to tumor growth.
This interdisciplinary project combines clinical, cell biological and bioinformatic research and it will reciprocally transfer knowledge between research, Tiina Jokela and host institute, University of Jyväskylä and secondment institutes; University of Helsinki and Helsinki University Hospital. The proposed project support researcher Tiina Jokela to also gain transferable independent research skills and support her future career goal to become the leader of her own academic research group in the cancer research field.
Ámbito científico
Programa(s)
Régimen de financiación
MSCA-IF-EF-RI - RI – Reintegration panelCoordinador
40100 Jyvaskyla
Finlandia