Descrizione del progetto
Prevedere la specificità di legame delle cellule T contro gli antigeni del cancro
I linfociti T sono cellule chiave del sistema immunitario che riconoscono gli antigeni sulle cellule infette e le uccidono direttamente o stimolano altre cellule a montare una risposta immunitaria. Eppure, molti aspetti relativi ai meccanismi dell’immunità mediata dalle cellule T rimangono irrisolti. Il progetto MT-PoINT, finanziato dall’UE, si propone di comprendere la specificità di legame delle cellule T. I ricercatori analizzeranno i dati di sequenziamento per identificare i modelli predittivi dell’interazione del recettore delle cellule T con un dato epitopo antigenico. I risultati miglioreranno significativamente la progettazione e lo sviluppo di immunoterapie personalizzate che coinvolgono cellule T ingegnerizzate.
Obiettivo
T cells are a key element of the human immune system. Upon binding to antigenic peptides (called T cell epitopes), T cells can induce the death of infected cells or prime and regulate other immune cells. In cancer immunotherapy treatments, T cells are genetically re-engineered to recognize cancer epitopes and destroy malignant cells. Unfortunately, it still remains challenging to determine which T cells can target a specific epitope, both from a computational and experimental point of view. This limits mechanistic understanding of T-cell-mediated immunity and translational applications for disease treatments.
Thanks to advances in high-throughput sequencing technologies, sequence data of T cells coupled with their cognate epitopes are accumulating at an unprecedented pace, offering unique opportunities to develop data-driven T cell-epitope interaction predictors.
The goal of the MT-PoINT project (Motif in T cells for the Prediction of INTeractions) is to identify patterns in T cells sequences that underlie the binding specificity, interpret them at the structural level, and to develop sequence-based predictors of T cell-epitope interactions (Aim1) with a special focus on T cells targeting cancer epitopes (Aim2). My project will capitalize on a unique dataset of publicly available and in-house generated data that was not available in previous studies, and T cell sequence data from cancer patients of Lausanne University Hospital will allow me to benchmark the in-silico predictors in a clinically relevant setting.
Accurate predictions of TCR-epitope interactions can narrow down the list of T cell candidates for personalized cancer immunotherapies, and significantly accelerate cancer immunotherapy clinical developments.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole
- scienze mediche e della salute medicina clinica oncologia
- scienze mediche e della salute medicina di base immunologia immunoterapia
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMMA PRINCIPALE
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2020
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Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.
1015 LAUSANNE
Svizzera
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.