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Nucleotide metabolism crosstalk in cancer: A single cell approach

Descrizione del progetto

La tecnologia a singola cellula contribuisce a definire le fonti di sintesi de novo dei nucleotidi

La sintesi de novo dei nucleotidi è essenziale per la proliferazione cellulare e la sua alterazione è dannosa per le cellule tumorali che si moltiplicano rapidamente. La terapia antinucleotidica è stata uno dei primi approcci al trattamento del cancro, ma la sintesi de novo dei nucleotidi può essere aggirata dall’assorbimento di nucleotidi extracellulari o attraverso percorsi di riciclo, limitando l’efficacia della terapia. Le fonti cellulari di nucleotidi nei tessuti normali e nei tumori in vivo non sono ancora state adeguatamente caratterizzate ed è proprio l’obiettivo principale del progetto MetaCross, finanziato dall’UE, oltre alla comprensione degli adattamenti al blocco della sintesi de novo dei nucleotidi nel cancro. La ricerca comporterà un approccio integrativo in vivo utilizzando la tecnologia a singola cellula combinata ad analisi omica a singola cellula, bioinformatica avanzata e modelli murini all’avanguardia.

Obiettivo

DNA synthesis is essential for cell proliferation. Nucleotides, the basic building blocks of nucleic acids, are made by nucleotide de novo synthesis (DNS), and DNS disruption is detrimental to rapidly proliferating cancer cells. Established >70 years ago, anti-nucleotide therapy was one of the first approaches to treat cancer, but it suffers high rate of resistance and relapse. DNS can be bypassed by an uptake of extracellular nucleotides or by recycling in salvage pathways, possibly a reason for limited efficacy of anti-nucleotide therapy. To date, the cellular sources of nucleotides in normal tissue and in tumors in vivo remain poorly characterized. The central goal of this project is to define these nucleotide sources, understand the intercellular metabolic crosstalk of nucleotides in tumors, and characterize the adaptations to DNS blockade in cancer and stromal cells. To reach these goals, I will use the totally new perspective brought by the single cell technology and combine my expertise in single cell omics and metabolism with the state-of-the-art mouse models and advanced bioinformatics available at the host institute. I propose an integrative in vivo approach using single cell RNA-sequencing, which in combination with genetic interventions will allow me to resolve dynamic expression profiles of individual cell types. I will use inducible mouse models to selectively disable DNS in the stroma (lungs of a host animal) and in cancer cells (orthotopic tumors from syngeneic DNS-deficient lung cancer cells) to generate tumors fully relying on nucleotides from internal or external sources, respectively. In parallel, I will perform in vivo CRISPR screen to identify genes whose lack represents a targetable metabolic dependency of DNS-disabled cancer cells. This innovative approach will shed novel insights into organization of tumor metabolic homeostasis and identify new targets with the potential to make major breakthrough in anti-nucleotide intervention in cancer.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2020

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

BIOTECHNOLOGICKY USTAV AV CR VVI
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 156 980,64
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 156 980,64
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