Projektbeschreibung
Mit neuer Technologie nicht-kodierende RNA sequenzieren
Das Verfahren der RNA-Sequenzierung dient der quantitativen Analyse von Boten-RNA-Molekülen in einer biologischen Probe. Es ist jedoch auf die proteinkodierenden RNA-Varianten beschränkt und kann keine Sequenzen anderer RNA-Moleküle wie etwa kleiner nicht-kodierender RNA liefern. Ziel des EU-finanzierten Projekts droplet-small-seq ist, diese Einschränkung zu beseitigen sowie Einblicke in die Expression und Funktion von microRNA in einzelnen Zellen zuzulassen. Das Team wird eine auf Tröpfchen basierende Hochdurchsatztechnologie zur gleichzeitigen Erfassung und Sequenzierung von microRNA und mRNA entwickeln. Angesichts der regulatorischen Funktion der nicht-kodierenden RNA bei der Genexpression ist zu erwarten, dass es für die Herangehensweise des Projekts vielfach nützliche Anwendungsmöglichkeiten in der Forschung geben wird.
Ziel
Droplet-based single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq) technologies have penetrated almost all branches of life sciences and have significantly advanced our understanding of cellular processes and organism development. However, despite their astonishing impact, most of the scRNA-seq technologies reported to date rely on poly(A) tail capture and thus are mainly restricted to the protein-coding RNAs, while neglecting a substantial proportion of the transcriptome, including small non-coding RNAs. As a result, very little is known about the non-coding RNA expression and function in individual cells, and especially their role in the establishment of cellular phenotypic diversity. Small RNAs contain a variety of classes, of which miRNAs are the most common and these act as regulatory molecules by suppressing translation of mRNAs. In addition, loss-of-function studies of miRNAs uncovered their involvement in development of nearly all tissues, including hematopoiesis. However, most studies exploring miRNA dynamics reported to date relied on bulk cell assays, thus disregarding the individual cell types and their heterogeneity. In the scope of this proposal, we aim to develop a high-throughput droplet-based single-cell small RNA-seq (droplet-small-seq) for simultaneous miRNA and mRNA capture and sequencing. We will apply this newly developed technique to investigate the regulatory roles of miRNAs in cell fate decision during hematopoietic development at a single-cell level.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
HAUPTPROGRAMM
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2020
Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigenKoordinator
Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
01513 Vilnius
Litauen
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.