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Interactions between chromatin and transposable elements in rapid adaptation to environmental stress

Descrizione del progetto

In che modo i moscerini della frutta si adattano alle perturbazioni ambientali

Le interazioni sensibili all’ambiente tra epigenoma ed elementi trasponibili sono sostenute da stati cromatinici dinamici che disciplinano l’espressione genica. La comprensione della modalità di variazione della cromatina nelle popolazioni e del suo grado di reazione ai cambiamenti ambientali risulta fondamentale per valutare il ruolo delle interazioni tra epigenoma ed elementi trasponibili durante il processo di adattamento. Il progetto InterChromaTE, finanziato dall’UE, si dedicherà alla misurazione della variazione naturale nell’accessibilità della cromatina in diverse popolazioni di comuni moscerini della frutta (D. melanogaster), e all’individuazione delle correlazioni tra accessibilità della cromatina ed elementi trasponibili polimorfici. Verranno inoltre misurati alcuni risultati riguardanti meccanismi di prossimità (RNA e risposte della cromatina allo stress) e fenotipi (tratti della storia esistenziale) nell’arco di numerose generazioni. Le conseguenze evolutive di più lungo termine saranno misurate in popolazioni invasive e native di D. melanogaster e nelle recenti specie invasive di parassiti D. suzukii.

Obiettivo

Understanding how organisms adapt to the environmental perturbations, including those caused by human activity, is a key question in evolutionary biology. Some organisms appear to adapt more rapidly than expected, and two factors predicted to contribute to this are environmentally sensitive epigenome regulation and transposable element (TE) activity under stress. Recent molecular studies have shown how interactions between the epigenome and TEs can affect genome evolution in the fruitfly Drosophila melanogaster. However, little is known about how these processes interact in natural populations, limiting our understanding of their role in population adaptation under environmental change.

Environmentally sensitive interactions between the epigenome and TEs are underpinned by dynamic chromatin states regulating gene expression. Understanding how chromatin varies across populations and how responsive it is to environmental change is key to evaluating the role of epigenome-TE interactions in adaptation. Here we will measure natural variation in chromatin accessibility in different populations of D. melanogaster and look for associations between chromatin accessibility and polymorphic TEs. Proximate mechanisms (RNA and chromatin responses to stress) and phenotypic outcomes (life history traits) will be measured over multiple generations. Longer term evolutionary consequences will be measured in invasive and native populations of D. melanogaster and the more recently invading D. suzukii, and TEs associated with differential chromatin regulation in invasive populations will be validated using functional genomics techniques including CRISPR-Cas9.

These data will reveal how interactions between chromatin states and TEs can shape adaptation over different organisational scales, from the molecular to the population-level, and across different temporal scales, including within-generation acclimation, transgenerational epigenetic change and long-term evolutionary change.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2020

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 160 932,48
Indirizzo
CALLE SERRANO 117
28006 MADRID
Spagna

Mostra sulla mappa

Regione
Comunidad de Madrid Comunidad de Madrid Madrid
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 160 932,48
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