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Automated Model Inference from Neural Dynamics for a Mechanistic Understanding of Cognition

Descrizione del progetto

Un modello basato sull’apprendimento automatico per lo studio approfondito della cognizione

L’introduzione di modelli meccanicistici ben allineati con dati sperimentali potrebbe migliorare considerevolmente la comprensione delle proprietà cellulari e di rete alla base della cognizione, nonché delle cause sottostanti a determinate condizioni patologiche. Finanziato dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto AutoMIND si propone di sviluppare uno strumento di inferenza del modello basato sull’apprendimento automatico che sia in grado di identificare i parametri di particolari modelli di reti neurali spiking acquisendo al contempo le dinamiche neurali di destinazione arbitrarie da registrazioni del cervello umano. Lo strumento sfrutta i recenti progressi nelle tecniche di inferenza basate sulla simulazione, incorporando l’apprendimento simultaneo di molteplici parametri e simulazioni basate su gradiente. Inoltre è in grado di risolvere problemi neuroscientifici attraverso esperimenti in silico.

Obiettivo

Human cognition depends on complex coordinated dynamics of neural populations, which is shaped by a rich heterogeneity in cellular properties and network connectivity patterns of neural circuits. While cognitive neuroscience leverages macroscopic brain signals to relate neural activity to behavioral states, we currently cannot dissect them for their physiological contributions, hindering mechanistic interpretations of experimental data. One way to systematically study how physiological parameters shape neural dynamics is through mechanistic modeling of spiking neural networks. However, current modeling approaches are not quantitatively constrained by observed electrophysiological data, and often require painstaking and ad-hoc parameter-tuning by hand. Efficient discovery of mechanistic models that are consistent with experimental data would dramatically accelerate our understanding of how cellular and network properties impact cognition, and why it breaks down in pathological states, representing a radical departure from how neural data is analyzed in cognitive neuroscience. To this end, I propose to develop a machine learning-assisted model inference tool—Automated Model Inference from Neural Dynamics (AutoMIND)—that can identify parameters of candidate spiking neural network models that could capture arbitrary target neural dynamics from human brain recordings. AutoMIND extends on recent advances in simulation-based inference techniques, incorporating simultaneous parameter manifold-learning and gradient-based simulations. AutoMIND has broad utility for tackling neuroscientific questions by enabling expedited in-silico experiments. Here, I apply it to multiscale neural data to study how cellular and network properties shape: 1) the emergence of synchronous network oscillations during early neurodevelopment, and 2) the difference in neural dynamics and computation between sensory and association cortices—two questions of fundamental importance to neuroscience.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2020

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

EBERHARD KARLS UNIVERSITAET TUEBINGEN
Contributo netto dell'UE
€ 162 806,40
Indirizzo
GESCHWISTER-SCHOLL-PLATZ
72074 Tuebingen
Germania
Regione
Baden-Württemberg Tübingen Tübingen, Landkreis
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale
€ 162 806,40