Projektbeschreibung
Neue Analysemethode: Räumliche Transkriptomik in der Arthroseforschung
Arthrose ist eine schmerzhafte chronische Erkrankung von Muskeln und Knochen, die Behinderung oder Tod zur Folge haben kann. Mithilfe von verschiedenen Omik-Analysen und Einzelzellsequenzierung von RNA konnten die beteiligten Zellgruppen gefunden werden. Das EU-finanzierte Projekt SpatialArth will nun mit einer neuartigen und hochmodernen Technologie – der räumlichen Transkriptomik – die molekulare Ätiopathogenese und das Fortschreiten der Arthrose nachvollziehen. Die räumliche Transkriptomik erlaubt in den einzelnen Gewebeabschnitten sowohl Visualisierung als auch eine quantitative Analyse des Transkriptoms mit einer räumlichen Auflösung, die sich annähernd in der Größe einzelner Zellen bewegt. Aus der Kombination von Sequenzierung mit räumlicher Transkriptomik und Daten zur Proteinexpression aus Knorpel- und Knochengewebe ergeben sich neue Erkenntnisse über das molekulare Profil der osteochondralen Einheit und darüber, welche Zellen an der Pathogenese von Arthrose beteiligt sind.
Ziel
Osteoarthritis (OA) is the most prevalent chronic musculoskeletal disorder causing pain, morbidity and disability, giving rise to enormous healthcare expenditures and loss of work. The exact triggers and pathogenesis of OA are still poorly understood. Currently, there are no measures to slow down the progression of OA. Bulk tissue-based multi-omics and small-scale single cell RNA-seq studies focussing on chondrocytes and synoviocytes have identified novel cell clusters, supporting the hypothesis that OA is a disease of the whole joint. However, one of the key relevant tissues (bone) have not yet been studied. In addition, approaches to date have employed lengthy live cell extraction approaches that affect the transcriptome pattern. Finally, the spatial dimension of molecular changes in the osteochondral unit has not been studied to date. This work will fill this fundamental gap in our understanding of the molecular aetiopathogenesis and progression of OA by employing a novel cutting-edge technique, spatial transcriptomics (ST). ST acts like a high-throughput molecular microscope to allow visualisation and quantitative analysis of the transcriptome with spatial resolution in individual tissue sections, affording near-single cell resolution. SpatialArth will generate new knowledge on the molecular profile of the osteochondral unit and will identify with spatial resolution which cells are involved in the pathogenesis of OA. I will combine ST sequencing and protein expression data from cartilage and bone tissues from OA patients (matched tissues from intact and degraded regions of tibial plateau) and tissues derived from non-OA knee joints. Additionally, I will develop my computational genomics skillset, aiming to help fill the need for a much-needed next generation of interdisciplinary researchers. SpatialArth addresses several mandatory European Union calls - finding strategies supporting healthy and active aging and decreasing the economic burden on healthcare.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
Sie müssen sich anmelden oder registrieren, um diese Funktion zu nutzen
Wir bitten um Entschuldigung ... während der Ausführung ist ein unerwarteter Fehler aufgetreten.
Sie müssen sich authentifizieren. Ihre Sitzung ist möglicherweise abgelaufen.
Vielen Dank für Ihr Feedback. Sie erhalten in Kürze eine E-Mail zur Übermittlungsbestätigung. Wenn Sie sich für eine Benachrichtigung über den Berichtsstatus entschieden haben, werden Sie auch im Falle einer Änderung des Berichtsstatus benachrichtigt.
Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
HAUPTPROGRAMM
Alle im Rahmen dieses Programms finanzierten Projekte anzeigen -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Alle im Rahmen dieses Programms finanzierten Projekte anzeigen
Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) H2020-MSCA-IF-2020
Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigenKoordinator
Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
85764 Neuherberg
Deutschland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.