The Paris DYNAMO Fellowship Programme

Projektinformationen

FP-DYNAMO-PARIS

ID Finanzhilfevereinbarung: 101034407

DOI

10.3030/101034407

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 19 April 2021

Startdatum 1 September 2021

Enddatum 31 August 2026

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Gesamtkosten

€ 2 795 280,00

EU-Beitrag

€ 1 397 640,00

Koordiniert durch

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France

CORDIS bietet Links zu öffentlichen Ergebnissen und Veröffentlichungen von HORIZONT-Projekten.

Links zu Ergebnissen und Veröffentlichungen von RP7-Projekten sowie Links zu einigen Typen spezifischer Ergebnisse wie Datensätzen und Software werden dynamisch von OpenAIRE abgerufen.

Leistungen

Documents, reports (2)

Link for Euraxess website for Call 2

Inform the Project Officer on publishing each call for proposals by sending the link to the Euraxess website and a screen shot of the related call announcement

Link to Euraxess website for Call 1

Inform the Project Officer on publishing each call for proposals by sending the link to the Euraxess website and a screen shot of the related call announcement

Veröffentlichungen

Other (4)

Studying the regulons of OmrA and OmrB paralogous small RNAs reveals targets involved in central carbon metabolism and lipogenesis

Autoren: Alexey Korepanov, Jonathan Jagodnik, Fanny Quenette, Thao Nguyen Le Lam, Marion Hamon, Jade Mathis De Fromont, Odile Sismeiro, Valentin Gherdol-Nouvion, Alexandre Maes, Maude Guillier
Veröffentlicht in: BioRxiv, 2026
Herausgeber: openRxiv
DOI: 10.64898/2026.06.26.734639

30S-seq redefines the bacterial Ribosome Binding Site

Autoren: Jonathan Jagodnik, Valentin Gherdol-Nouvion, Mira Al Sahmarani, Alexandre Maes, Maude Guillier
Veröffentlicht in: BioRxiv, 2026
Herausgeber: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.04.04.647229

The first photosynthetic mutant in diatoms targets the subunit γ of plastidial ATP synthase and reveals a key role of thylakoid electrochemical proton gradient in photosynthesis regulation and heterotrophic metabolism

Autoren: Erik Jensen, Sien Audoor, Richard Kuras, Brignone Seleem, Alessandra Rogato, Giuliana D’Ippolito, Giovanna Benvenuto, Angelo Fontana, Yves Choquet, Benjamin Bailleul, Angela Falciatore
Veröffentlicht in: BioRxiv, 2026
Herausgeber: openRxiv
DOI: 10.1101/2025.10.10.681070

F1F0-ATP-synthase subunit b head-to-head interactions shape intracellular membranes in Escherichia coli

Autoren: Mukul S Kareya, Jorge Royes, Federica Angius, Florence Szczepaniak, Francesco Boldrin, Marion Hamon, Pauline Talbot, Oana Ilioaia, Celine Madigou, Christophe Tribet, Francois Dehez, Florent Waltz, Francesca Zito, Bruno MIROUX
Veröffentlicht in: BioRxiv, 2026
Herausgeber: openRxiv
DOI: 10.64898/2026.03.03.708934

Peer reviewed articles (18)

Structural profiles of the full phagocyte NADPH oxidase unveiled by combining computational biology and experimental knowledge

Autoren: Sana Aimeur, Burcu Aykac Fas, Xavier Serfaty, Hubert Santuz, Sophie Sacquin-Mora, Tania Bizouarn, Antoine Taly, Laura Baciou
Veröffentlicht in: Journal of Biological Chemistry, Ausgabe 300, 2025, Seite(n) 107943, ISSN 0021-9258
Herausgeber: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.jbc.2024.107943

A Perspective on the Prospective Use of AI in Protein Structure Prediction

Autoren: Raphaelle Versini, Sujith Sritharan, Burcu Aykac Fas, Thibault Tubiana, Sana Zineb Aimeur, Julien Henri, Marie Erard, Oliver Nüsse, Jessica Andreani, Marc Baaden, Patrick Fuchs, Tatiana Galochkina, Alexios Chatzigoulas, Zoe Cournia, Hubert Santuz, Sophie Sacquin-Mora, Antoine Taly
Veröffentlicht in: Journal of Chemical Information and Modeling, Ausgabe 64, 2024, Seite(n) 26-41, ISSN 1549-9596
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jcim.3c01361

Structure and elasticity of healthy and Alzheimer's disease cell membranes revealed by molecular dynamics simulations

Autoren: Thi Ly Mai, Hoa Thi Nguyen, Philippe Derreumaux, Phuong H. Nguyen
Veröffentlicht in: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, Ausgabe 93, 2025, Seite(n) 1349-1360, ISSN 0887-3585
Herausgeber: Wiley-Liss Inc
DOI: 10.1002/prot.26508

Structure and Elasticity of Mitochondrial Membranes: A Molecular Dynamics Simulation Study

Autoren: Thi Ly Mai, Philippe Derreumaux, Phuong H. Nguyen
Veröffentlicht in: The Journal of Physical Chemistry B, Ausgabe 127, 2023, Seite(n) 10778-10791, ISSN 1520-6106
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpcb.3c05112

The thiolation of U34 at carbon 2 in tRNA by Escherichia coli MnmA precedes modification at carbon 5 and is dependent on a [4Fe-4S] cluster

Autoren: Sylvain Gervason, Sambuddha Sen, Jingjing Zhou, Karolina Podskoczyj, Grazyna Leszczynska, Sylvain Caillat, Jean-Luc Ravanat, Marc Fontecave, Béatrice Golinelli-Pimpaneau
Veröffentlicht in: Journal of Inorganic Biochemistry, Ausgabe 274, 2026, Seite(n) 113064, ISSN 0162-0134
Herausgeber: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.jinorgbio.2025.113064

Status of Alzheimer’s and Parkinson’s Disease Detections and Treatments

Autoren: Phuong H. Nguyen, Philippe Derreumaux
Veröffentlicht in: ACS Chemical Neuroscience, Ausgabe 17, 2026, Seite(n) 2441-2453, ISSN 1948-7193
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acschemneuro.6c00096

Modeling stable cavitation of coated microbubbles: A framework integrating smoothed dissipative particle dynamics and the Rayleigh–Plesset equation

Autoren: Phuong H. Nguyen
Veröffentlicht in: The Journal of Chemical Physics, Ausgabe 161, 2024, ISSN 0021-9606
Herausgeber: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0220395

Disentangling the pseudoknots of toxin translation

Autoren: Jonathan Jagodnik, Fabien Darfeuille, Maude Guillier
Veröffentlicht in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Ausgabe 121, 2024, ISSN 0027-8424
Herausgeber: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2411591121

Mitofusin-mediated contacts between mitochondria and peroxisomes regulate mitochondrial fusion

Autoren: Cynthia Alsayyah, Manish K. Singh, Maria Angeles Morcillo-Parra, Laetitia Cavellini, Nadav Shai, Christine Schmitt, Maya Schuldiner, Einat Zalckvar, Adeline Mallet, Naïma Belgareh-Touzé, Christophe Zimmer, Mickaël M. Cohen
Veröffentlicht in: PLOS Biology, Ausgabe 22, 2024, Seite(n) e3002602, ISSN 1545-7885
Herausgeber: Public Library of Science (PLoS)
DOI: 10.1371/journal.pbio.3002602

Molecular dynamics simulation of cancer cell membrane perforated by shockwave induced bubble collapse

Autoren: Nguyen Hoang Linh, Viet Hoang Man, Mai Suan Li, Junmei Wang, Philippe Derreumaux, Thi Ly Mai, Phuong H. Nguyen
Veröffentlicht in: The Journal of Chemical Physics, Ausgabe 157, 2023, ISSN 0021-9606
Herausgeber: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0105675

Riboswitch and small RNAs modulate <i>btuB</i> translation initiation in <i>Escherichia coli</i> and trigger distinct mRNA regulatory mechanisms

Autoren: Laurène Bastet, Alexey P Korepanov, Jonathan Jagodnik, Jonathan P Grondin, Anne-Marie Lamontagne, Maude Guillier, Daniel A Lafontaine
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 52, 2024, Seite(n) 5852-5865, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae347

Advances in Human Pre-tRNA Maturation: TRMT10C and ELAC2 in Focus

Autoren: Juhi Sikarwar, Vincent Meynier, Carine Tisné
Veröffentlicht in: Journal of Molecular Biology, Ausgabe 437, 2026, Seite(n) 168989, ISSN 0022-2836
Herausgeber: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2025.168989

A constricted mitochondrial morphology formed during respiration

Autoren: Manish K. Singh, Laetitia Cavellini, Maria Angeles Morcillo-Parra, Christina Kunz, Mickaël Lelek, Perrine Bomme, Aurélia Barascu, Cynthia Alsayyah, Maria Teresa Teixeira, Naïma Belgareh-Touzé, Adeline Mallet, Lea Dietrich, Christophe Zimmer, Mickael M. Cohen
Veröffentlicht in: Nature Communications, Ausgabe 16, 2025, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-025-60658-9

Dissecting the Mechanism of Biosynthesis of Sulfurated Biomolecules: The Case of tRNA Sulfuration

Autoren: Sylvain Gervason, Marc Fontecave, Béatrice Golinelli-Pimpaneau
Veröffentlicht in: Accounts of Chemical Research, Ausgabe 58, 2025, Seite(n) 3146-3153, ISSN 0001-4842
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.accounts.5c00485

Control of iron acquisition by multiple small RNAs unravels a new role for transcriptional terminator loops in gene regulation

Autoren: Eugenio Solchaga Flores, Jonathan Jagodnik, Fanny Quenette, Alexey Korepanov, Maude Guillier
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, Ausgabe 52, 2025, Seite(n) 13775-13791, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkae1131

Stability and cavitation of nanobubble: Insights from large-scale atomistic molecular dynamics simulations

Autoren: Viet Hoang Man, Mai Suan Li, Philippe Derreumaux, Phuong H. Nguyen
Veröffentlicht in: The Journal of Chemical Physics, Ausgabe 161, 2024, ISSN 0021-9606
Herausgeber: American Institute of Physics
DOI: 10.1063/5.0230903

Purinosome Unmasked: Exploring the Molecular-Scale Structure of a Purinosome Complex In Silico

Autoren: Florencia Klein, Stepan Timr, Simon Ebbinghaus, Fabio Sterpone
Veröffentlicht in: The Journal of Physical Chemistry Letters, 2025, Seite(n) 8252-8261, ISSN 1948-7185
Herausgeber: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.5c01870

Evolution, structure and function of L-cysteine desulfidase, an enzyme involved in sulfur metabolism in the methanogenic archeon Methanococcus maripaludis

Autoren: Sylvain Gervason, Paolo Zecchin, Elliot B. Shelton, Nisha He, Ludovic Pecqueur, Pierre Simon Garcia, Taiwo Akinyemi, Nadia Touati, Ornella Bimai, Christophe Velours, Jean-Luc Ravanat, Bruno Faivre, William B. Whitman, Marc Fontecave, Béatrice Golinelli-Pimpaneau
Veröffentlicht in: Communications Biology, Ausgabe 8, 2025, ISSN 2399-3642
Herausgeber: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s42003-025-09053-0