Exploring the Prokaryotic-Eukaryotic Conservation of Antiviral immunity: from bacterial immune systems to novel antiviral drugs

Información del proyecto

PECAN

Identificador del acuerdo de subvención: 101040529

DOI

10.3030/101040529

Fecha de la firma de la CE 22 Abril 2022

Fecha de inicio 1 Octubre 2022

Fecha de finalización 30 Septiembre 2027

Financiado con arreglo a

• European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 496 500,00

Aportación de la UE

€ 1 496 500,00

Coordinado por

INSTITUT PASTEUR
France

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Publicaciones

Peer reviewed articles (16)

Exploring the diversity of anti-defense systems across prokaryotes, phages, and mobile genetic elements

Autores: Tesson F., Huiting E., Wei L., Ren J., Johnson M., Planel R., Cury J., Feng Y., Bondy-Denomy J., Bernheim A
Publicado en: bioRxiv, 2024, ISSN 0305-1048
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.08.21.608784

A family of lanthipeptides with anti-phage function

Autores: Shomar H., Tesson F., Guillaume M., Ongenae V., Le Bot N., Georjon H., Mordret E., Zhang L., van Wezel G., Rozen D., Briegel A., Zirah S., Claessen D., Li Y., Bernheim A.
Publicado en: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.06.26.600839

A Comprehensive Resource for Exploring Antiphage Defense: DefenseFinder, Wiki and Databases

Autores: Tesson F., Planel R., Egorov A., Georjon H., Vaysset H., Brancotte B., Neron B., Mordret E., Atkinson G., Bernheim A., Cury J.
Publicado en: Peer Community Journal, 2024, ISSN 2804-3871
Editor: Peer Community
DOI: 10.24072/pcjournal.470

Cell Host and Microbe

Autores: Cury J., Haudiquet M., Hernandez-Trejo V., Mordret E., Hanouna A., Rotival M., Tesson F., Bonhomme D., Ofir G., Quintana-Murci L., Benaroch P., Poirier E.Z., Bernheim A.*
Publicado en: Cell Host and Microbe, 2024, ISSN 1931-3128
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2024.08.002

Exploring the diversity of anti-defense systems across prokaryotes, phages and mobile genetic elements

Autores: Florian Tesson; Erin Huiting; Linlin Wei; Jie Ren; Matthew C. Johnson; Remi Planel; Jean Cury; Yue Feng; Joseph Bondy-Denomy; Aude Bernheim
Publicado en: Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 1362-4962
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2024.08.21.608784

Strain phylogroup and environmental constraints shape <i>Escherichia coli</i> dynamics and diversity over a 20-year human gut time series

Autores: Condamine, Bénédicte; Morel-Journel, Thibaut; Tesson, Florian; Royer, Guilhem; Magnan, Mélanie; Bernheim, Aude; Denamur, Erick; Blanquart, François; Clermont, Olivier
Publicado en: The ISME Journal, 2024, ISSN 1751-7370
Editor: xford University Press, on behalf of the International Society for Microbial Ecology (ISME)
DOI: 10.1093/ISMEJO/WRAE245

A human homolog of SIR2 antiphage proteins mediates immunity via the TLR pathway

Autores: Bonhomme D., Vaysset H., Ednacot E.M.Q., Rodrigues V., Cury J., Hernandez Trejo V., Benaroch P., Morehouse B.R., Bernheim A., Poirier E.Z.
Publicado en: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Editor: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.06.15.547839

Prediction of strain level phage–host interactions across the Escherichia genus using only genomic information

Autores: Gaborieau B., Vaysset H., Tesson F.*, Charachon I., Dib N., Bernier J., Dequidt T., Georjon H., Clermont O., Hersen P., Debarbieux L., Ricard J.D., Denamur E., Bernheim A.
Publicado en: Nature Microbiology, 2024, ISSN 2058-5276
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41564-024-01832-5

Systematic and quantitative view of the anti-viral arsenal of prokaryotes

Autores: Tesson F., Hervé A., Touchon M., Mordret E., d’Humières C., Cury J., Bernheim A.
Publicado en: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-30269-9

Microbiology

Autores: Georjon H., Tesson F., Shomar H., Bernheim A.
Publicado en: Microbiology, 2023, ISSN 1350-0872
Editor: Microbiology Society
DOI: 10.1099/mic.0.001374

The highly diverse antiphage defence systems of bacteria

Autores: Georjon H., Bernheim A.
Publicado en: Nature Reviews Microbiology, 2023, ISSN 1740-1526
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41579-023-00934-x

PLoS Biology

Autores: Bernheim A., Cury J., Poirier E.Z.
Publicado en: PloS Biology, 2024, ISSN 1544-9173
Editor: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3002717

Viperin immunity evolved across the tree of life through serial innovations on a conserved scaffold

Autores: Helena Shomar; Héloïse Georjon; Yanlei Feng; Bismarck Olympio; Marie Guillaume; Florian Tesson; Jean Cury; Fabai Wu; Aude Bernheim
Publicado en: Nature Ecology & Evolution, 2024, ISSN 2397-334X
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41559-024-02463-z

Evolutionary origins of archaeal and eukaryotic RNA-guided RNA modification in bacterial IS110 transposons

Autores: Hugo Vaysset; Chance Meers; Jean Cury; Aude Bernheim; Samuel H. Sternberg
Publicado en: Nature Microbiology, 2025, ISSN 2058-5276
Editor: Nature Portfolio
DOI: 10.1101/2024.06.21.599552

A virally-encoded tRNA neutralizes the PARIS antiviral defence system

Autores: Burman N., Belukhina S., Depardieu F., Wilkinson R., Skutel M., Santiago-Frangos A., Graham A., Livenskyi A., Chechenina A., Morozova N., Zahl T., Henriques W., Buyukyoruk M., Rouillon C., Shyrokova L., Kurata T., Hauryliuk V., Severinov K., Groseille J.,
Publicado en: Nature, 2024, ISSN 0028-0836
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-07874-3

Current Opinion in Microbiology

Autores: Tesson F., Bernheim A
Publicado en: Current Opinion in Microbiology, 2022, ISSN 1369-5274
Editor: Elsevier
DOI: 10.1016/j.mib.2022.102238