Exploring the Prokaryotic-Eukaryotic Conservation of Antiviral immunity: from bacterial immune systems to novel antiviral drugs

Informations projet

PECAN

N° de convention de subvention: 101040529

DOI

10.3030/101040529

Date de signature de la CE 22 Avril 2022

Date de début 1 Octobre 2022

Date de fin 30 Septembre 2027

Financé au titre de

• European Research Council (ERC)

Coût total

€ 1 496 500,00

Contribution de l’UE

€ 1 496 500,00

Coordonné par

INSTITUT PASTEUR
France

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Publications

Peer reviewed articles (16)

Exploring the diversity of anti-defense systems across prokaryotes, phages, and mobile genetic elements

Auteurs: Tesson F., Huiting E., Wei L., Ren J., Johnson M., Planel R., Cury J., Feng Y., Bondy-Denomy J., Bernheim A
Publié dans: bioRxiv, 2024, ISSN 0305-1048
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.08.21.608784

A family of lanthipeptides with anti-phage function

Auteurs: Shomar H., Tesson F., Guillaume M., Ongenae V., Le Bot N., Georjon H., Mordret E., Zhang L., van Wezel G., Rozen D., Briegel A., Zirah S., Claessen D., Li Y., Bernheim A.
Publié dans: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.06.26.600839

A Comprehensive Resource for Exploring Antiphage Defense: DefenseFinder, Wiki and Databases

Auteurs: Tesson F., Planel R., Egorov A., Georjon H., Vaysset H., Brancotte B., Neron B., Mordret E., Atkinson G., Bernheim A., Cury J.
Publié dans: Peer Community Journal, 2024, ISSN 2804-3871
Éditeur: Peer Community
DOI: 10.24072/pcjournal.470

Cell Host and Microbe

Auteurs: Cury J., Haudiquet M., Hernandez-Trejo V., Mordret E., Hanouna A., Rotival M., Tesson F., Bonhomme D., Ofir G., Quintana-Murci L., Benaroch P., Poirier E.Z., Bernheim A.*
Publié dans: Cell Host and Microbe, 2024, ISSN 1931-3128
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2024.08.002

Exploring the diversity of anti-defense systems across prokaryotes, phages and mobile genetic elements

Auteurs: Florian Tesson; Erin Huiting; Linlin Wei; Jie Ren; Matthew C. Johnson; Remi Planel; Jean Cury; Yue Feng; Joseph Bondy-Denomy; Aude Bernheim
Publié dans: Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 1362-4962
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2024.08.21.608784

Strain phylogroup and environmental constraints shape <i>Escherichia coli</i> dynamics and diversity over a 20-year human gut time series

Auteurs: Condamine, Bénédicte; Morel-Journel, Thibaut; Tesson, Florian; Royer, Guilhem; Magnan, Mélanie; Bernheim, Aude; Denamur, Erick; Blanquart, François; Clermont, Olivier
Publié dans: The ISME Journal, 2024, ISSN 1751-7370
Éditeur: xford University Press, on behalf of the International Society for Microbial Ecology (ISME)
DOI: 10.1093/ISMEJO/WRAE245

A human homolog of SIR2 antiphage proteins mediates immunity via the TLR pathway

Auteurs: Bonhomme D., Vaysset H., Ednacot E.M.Q., Rodrigues V., Cury J., Hernandez Trejo V., Benaroch P., Morehouse B.R., Bernheim A., Poirier E.Z.
Publié dans: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.06.15.547839

Prediction of strain level phage–host interactions across the Escherichia genus using only genomic information

Auteurs: Gaborieau B., Vaysset H., Tesson F.*, Charachon I., Dib N., Bernier J., Dequidt T., Georjon H., Clermont O., Hersen P., Debarbieux L., Ricard J.D., Denamur E., Bernheim A.
Publié dans: Nature Microbiology, 2024, ISSN 2058-5276
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41564-024-01832-5

Systematic and quantitative view of the anti-viral arsenal of prokaryotes

Auteurs: Tesson F., Hervé A., Touchon M., Mordret E., d’Humières C., Cury J., Bernheim A.
Publié dans: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-30269-9

Microbiology

Auteurs: Georjon H., Tesson F., Shomar H., Bernheim A.
Publié dans: Microbiology, 2023, ISSN 1350-0872
Éditeur: Microbiology Society
DOI: 10.1099/mic.0.001374

The highly diverse antiphage defence systems of bacteria

Auteurs: Georjon H., Bernheim A.
Publié dans: Nature Reviews Microbiology, 2023, ISSN 1740-1526
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41579-023-00934-x

PLoS Biology

Auteurs: Bernheim A., Cury J., Poirier E.Z.
Publié dans: PloS Biology, 2024, ISSN 1544-9173
Éditeur: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3002717

Viperin immunity evolved across the tree of life through serial innovations on a conserved scaffold

Auteurs: Helena Shomar; Héloïse Georjon; Yanlei Feng; Bismarck Olympio; Marie Guillaume; Florian Tesson; Jean Cury; Fabai Wu; Aude Bernheim
Publié dans: Nature Ecology & Evolution, 2024, ISSN 2397-334X
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41559-024-02463-z

Evolutionary origins of archaeal and eukaryotic RNA-guided RNA modification in bacterial IS110 transposons

Auteurs: Hugo Vaysset; Chance Meers; Jean Cury; Aude Bernheim; Samuel H. Sternberg
Publié dans: Nature Microbiology, 2025, ISSN 2058-5276
Éditeur: Nature Portfolio
DOI: 10.1101/2024.06.21.599552

A virally-encoded tRNA neutralizes the PARIS antiviral defence system

Auteurs: Burman N., Belukhina S., Depardieu F., Wilkinson R., Skutel M., Santiago-Frangos A., Graham A., Livenskyi A., Chechenina A., Morozova N., Zahl T., Henriques W., Buyukyoruk M., Rouillon C., Shyrokova L., Kurata T., Hauryliuk V., Severinov K., Groseille J.,
Publié dans: Nature, 2024, ISSN 0028-0836
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-07874-3

Current Opinion in Microbiology

Auteurs: Tesson F., Bernheim A
Publié dans: Current Opinion in Microbiology, 2022, ISSN 1369-5274
Éditeur: Elsevier
DOI: 10.1016/j.mib.2022.102238