Exploring the Prokaryotic-Eukaryotic Conservation of Antiviral immunity: from bacterial immune systems to novel antiviral drugs

Informazioni relative al progetto

PECAN

ID dell’accordo di sovvenzione: 101040529

DOI

10.3030/101040529

Data della firma CE 22 Aprile 2022

Data di avvio 1 Ottobre 2022

Data di completamento 30 Settembre 2027

Finanziato da

• European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 1 496 500,00

Contributo UE

€ 1 496 500,00

Coordinato da

INSTITUT PASTEUR
France

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (16)

Exploring the diversity of anti-defense systems across prokaryotes, phages, and mobile genetic elements

Autori: Tesson F., Huiting E., Wei L., Ren J., Johnson M., Planel R., Cury J., Feng Y., Bondy-Denomy J., Bernheim A
Pubblicato in: bioRxiv, 2024, ISSN 0305-1048
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.08.21.608784

A family of lanthipeptides with anti-phage function

Autori: Shomar H., Tesson F., Guillaume M., Ongenae V., Le Bot N., Georjon H., Mordret E., Zhang L., van Wezel G., Rozen D., Briegel A., Zirah S., Claessen D., Li Y., Bernheim A.
Pubblicato in: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.06.26.600839

A Comprehensive Resource for Exploring Antiphage Defense: DefenseFinder, Wiki and Databases

Autori: Tesson F., Planel R., Egorov A., Georjon H., Vaysset H., Brancotte B., Neron B., Mordret E., Atkinson G., Bernheim A., Cury J.
Pubblicato in: Peer Community Journal, 2024, ISSN 2804-3871
Editore: Peer Community
DOI: 10.24072/pcjournal.470

Cell Host and Microbe

Autori: Cury J., Haudiquet M., Hernandez-Trejo V., Mordret E., Hanouna A., Rotival M., Tesson F., Bonhomme D., Ofir G., Quintana-Murci L., Benaroch P., Poirier E.Z., Bernheim A.*
Pubblicato in: Cell Host and Microbe, 2024, ISSN 1931-3128
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2024.08.002

Exploring the diversity of anti-defense systems across prokaryotes, phages and mobile genetic elements

Autori: Florian Tesson; Erin Huiting; Linlin Wei; Jie Ren; Matthew C. Johnson; Remi Planel; Jean Cury; Yue Feng; Joseph Bondy-Denomy; Aude Bernheim
Pubblicato in: Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 1362-4962
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2024.08.21.608784

Strain phylogroup and environmental constraints shape <i>Escherichia coli</i> dynamics and diversity over a 20-year human gut time series

Autori: Condamine, Bénédicte; Morel-Journel, Thibaut; Tesson, Florian; Royer, Guilhem; Magnan, Mélanie; Bernheim, Aude; Denamur, Erick; Blanquart, François; Clermont, Olivier
Pubblicato in: The ISME Journal, 2024, ISSN 1751-7370
Editore: xford University Press, on behalf of the International Society for Microbial Ecology (ISME)
DOI: 10.1093/ISMEJO/WRAE245

A human homolog of SIR2 antiphage proteins mediates immunity via the TLR pathway

Autori: Bonhomme D., Vaysset H., Ednacot E.M.Q., Rodrigues V., Cury J., Hernandez Trejo V., Benaroch P., Morehouse B.R., Bernheim A., Poirier E.Z.
Pubblicato in: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.06.15.547839

Prediction of strain level phage–host interactions across the Escherichia genus using only genomic information

Autori: Gaborieau B., Vaysset H., Tesson F.*, Charachon I., Dib N., Bernier J., Dequidt T., Georjon H., Clermont O., Hersen P., Debarbieux L., Ricard J.D., Denamur E., Bernheim A.
Pubblicato in: Nature Microbiology, 2024, ISSN 2058-5276
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41564-024-01832-5

Systematic and quantitative view of the anti-viral arsenal of prokaryotes

Autori: Tesson F., Hervé A., Touchon M., Mordret E., d’Humières C., Cury J., Bernheim A.
Pubblicato in: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-30269-9

Microbiology

Autori: Georjon H., Tesson F., Shomar H., Bernheim A.
Pubblicato in: Microbiology, 2023, ISSN 1350-0872
Editore: Microbiology Society
DOI: 10.1099/mic.0.001374

The highly diverse antiphage defence systems of bacteria

Autori: Georjon H., Bernheim A.
Pubblicato in: Nature Reviews Microbiology, 2023, ISSN 1740-1526
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41579-023-00934-x

PLoS Biology

Autori: Bernheim A., Cury J., Poirier E.Z.
Pubblicato in: PloS Biology, 2024, ISSN 1544-9173
Editore: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3002717

Viperin immunity evolved across the tree of life through serial innovations on a conserved scaffold

Autori: Helena Shomar; Héloïse Georjon; Yanlei Feng; Bismarck Olympio; Marie Guillaume; Florian Tesson; Jean Cury; Fabai Wu; Aude Bernheim
Pubblicato in: Nature Ecology & Evolution, 2024, ISSN 2397-334X
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41559-024-02463-z

Evolutionary origins of archaeal and eukaryotic RNA-guided RNA modification in bacterial IS110 transposons

Autori: Hugo Vaysset; Chance Meers; Jean Cury; Aude Bernheim; Samuel H. Sternberg
Pubblicato in: Nature Microbiology, 2025, ISSN 2058-5276
Editore: Nature Portfolio
DOI: 10.1101/2024.06.21.599552

A virally-encoded tRNA neutralizes the PARIS antiviral defence system

Autori: Burman N., Belukhina S., Depardieu F., Wilkinson R., Skutel M., Santiago-Frangos A., Graham A., Livenskyi A., Chechenina A., Morozova N., Zahl T., Henriques W., Buyukyoruk M., Rouillon C., Shyrokova L., Kurata T., Hauryliuk V., Severinov K., Groseille J.,
Pubblicato in: Nature, 2024, ISSN 0028-0836
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-07874-3

Current Opinion in Microbiology

Autori: Tesson F., Bernheim A
Pubblicato in: Current Opinion in Microbiology, 2022, ISSN 1369-5274
Editore: Elsevier
DOI: 10.1016/j.mib.2022.102238