Exploring the Prokaryotic-Eukaryotic Conservation of Antiviral immunity: from bacterial immune systems to novel antiviral drugs

Projektinformationen

PECAN

ID Finanzhilfevereinbarung: 101040529

DOI

10.3030/101040529

EK-Unterschriftsdatum 22 April 2022

Startdatum 1 Oktober 2022

Enddatum 30 September 2027

Finanziert unter

• European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 496 500,00

EU-Beitrag

€ 1 496 500,00

Koordiniert durch

INSTITUT PASTEUR
France

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (16)

Exploring the diversity of anti-defense systems across prokaryotes, phages, and mobile genetic elements

Autoren: Tesson F., Huiting E., Wei L., Ren J., Johnson M., Planel R., Cury J., Feng Y., Bondy-Denomy J., Bernheim A
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2024, ISSN 0305-1048
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.08.21.608784

A family of lanthipeptides with anti-phage function

Autoren: Shomar H., Tesson F., Guillaume M., Ongenae V., Le Bot N., Georjon H., Mordret E., Zhang L., van Wezel G., Rozen D., Briegel A., Zirah S., Claessen D., Li Y., Bernheim A.
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.06.26.600839

A Comprehensive Resource for Exploring Antiphage Defense: DefenseFinder, Wiki and Databases

Autoren: Tesson F., Planel R., Egorov A., Georjon H., Vaysset H., Brancotte B., Neron B., Mordret E., Atkinson G., Bernheim A., Cury J.
Veröffentlicht in: Peer Community Journal, 2024, ISSN 2804-3871
Herausgeber: Peer Community
DOI: 10.24072/pcjournal.470

Cell Host and Microbe

Autoren: Cury J., Haudiquet M., Hernandez-Trejo V., Mordret E., Hanouna A., Rotival M., Tesson F., Bonhomme D., Ofir G., Quintana-Murci L., Benaroch P., Poirier E.Z., Bernheim A.*
Veröffentlicht in: Cell Host and Microbe, 2024, ISSN 1931-3128
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.chom.2024.08.002

Exploring the diversity of anti-defense systems across prokaryotes, phages and mobile genetic elements

Autoren: Florian Tesson; Erin Huiting; Linlin Wei; Jie Ren; Matthew C. Johnson; Remi Planel; Jean Cury; Yue Feng; Joseph Bondy-Denomy; Aude Bernheim
Veröffentlicht in: Nucleic Acids Research, 2024, ISSN 1362-4962
Herausgeber: Oxford University Press
DOI: 10.1101/2024.08.21.608784

Strain phylogroup and environmental constraints shape <i>Escherichia coli</i> dynamics and diversity over a 20-year human gut time series

Autoren: Condamine, Bénédicte; Morel-Journel, Thibaut; Tesson, Florian; Royer, Guilhem; Magnan, Mélanie; Bernheim, Aude; Denamur, Erick; Blanquart, François; Clermont, Olivier
Veröffentlicht in: The ISME Journal, 2024, ISSN 1751-7370
Herausgeber: xford University Press, on behalf of the International Society for Microbial Ecology (ISME)
DOI: 10.1093/ISMEJO/WRAE245

A human homolog of SIR2 antiphage proteins mediates immunity via the TLR pathway

Autoren: Bonhomme D., Vaysset H., Ednacot E.M.Q., Rodrigues V., Cury J., Hernandez Trejo V., Benaroch P., Morehouse B.R., Bernheim A., Poirier E.Z.
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2024, ISSN 2692-8205
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.06.15.547839

Prediction of strain level phage–host interactions across the Escherichia genus using only genomic information

Autoren: Gaborieau B., Vaysset H., Tesson F.*, Charachon I., Dib N., Bernier J., Dequidt T., Georjon H., Clermont O., Hersen P., Debarbieux L., Ricard J.D., Denamur E., Bernheim A.
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, 2024, ISSN 2058-5276
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41564-024-01832-5

Systematic and quantitative view of the anti-viral arsenal of prokaryotes

Autoren: Tesson F., Hervé A., Touchon M., Mordret E., d’Humières C., Cury J., Bernheim A.
Veröffentlicht in: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-30269-9

Microbiology

Autoren: Georjon H., Tesson F., Shomar H., Bernheim A.
Veröffentlicht in: Microbiology, 2023, ISSN 1350-0872
Herausgeber: Microbiology Society
DOI: 10.1099/mic.0.001374

The highly diverse antiphage defence systems of bacteria

Autoren: Georjon H., Bernheim A.
Veröffentlicht in: Nature Reviews Microbiology, 2023, ISSN 1740-1526
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41579-023-00934-x

PLoS Biology

Autoren: Bernheim A., Cury J., Poirier E.Z.
Veröffentlicht in: PloS Biology, 2024, ISSN 1544-9173
Herausgeber: Public Library of Science
DOI: 10.1371/journal.pbio.3002717

Viperin immunity evolved across the tree of life through serial innovations on a conserved scaffold

Autoren: Helena Shomar; Héloïse Georjon; Yanlei Feng; Bismarck Olympio; Marie Guillaume; Florian Tesson; Jean Cury; Fabai Wu; Aude Bernheim
Veröffentlicht in: Nature Ecology & Evolution, 2024, ISSN 2397-334X
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41559-024-02463-z

Evolutionary origins of archaeal and eukaryotic RNA-guided RNA modification in bacterial IS110 transposons

Autoren: Hugo Vaysset; Chance Meers; Jean Cury; Aude Bernheim; Samuel H. Sternberg
Veröffentlicht in: Nature Microbiology, 2025, ISSN 2058-5276
Herausgeber: Nature Portfolio
DOI: 10.1101/2024.06.21.599552

A virally-encoded tRNA neutralizes the PARIS antiviral defence system

Autoren: Burman N., Belukhina S., Depardieu F., Wilkinson R., Skutel M., Santiago-Frangos A., Graham A., Livenskyi A., Chechenina A., Morozova N., Zahl T., Henriques W., Buyukyoruk M., Rouillon C., Shyrokova L., Kurata T., Hauryliuk V., Severinov K., Groseille J.,
Veröffentlicht in: Nature, 2024, ISSN 0028-0836
Herausgeber: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41586-024-07874-3

Current Opinion in Microbiology

Autoren: Tesson F., Bernheim A
Veröffentlicht in: Current Opinion in Microbiology, 2022, ISSN 1369-5274
Herausgeber: Elsevier
DOI: 10.1016/j.mib.2022.102238